MIT-BIH介绍(二)什么是MIT-BIH?


MIT-BIH 简介

1. 数据来源:

1975年至1979年之间由Beth Israel医院心律失常实验室获得的4000多个长期动态心电图记录。其中约60%的记录来自住院患者,40%来自门诊。受试者为25位年龄在32至89岁之间的男性和22位年龄在23至89岁之间的女性。

 

2. 数据描述:

包含48个半小时两通道动态心电图记录,记录以每通道每秒360个样本的速度(采样率)在10 mV范围内以11位分辨率数字化。两位心脏病专家分别对每条记录进行注释(总共约110,000个注释)。在大多数记录中,一个通道是改良的肢体导联II (MLII),通过将电极放置在胸部获得,这是动态心电图记录的标准做法,另一个通道通常是V1(有时是V2、V4或V5,取决于受试者)。


 

3. 数据格式

参考文献:MIT-BIH心率失常数据库的识读及应用

百度文库

(1)头文件[.hea],存储方式ASCII码字符。
(2)数据文件[.dat],按二进制存储,每三个字节存储两个数,一个数12bit。
(3)注释文件[.atr],按二进制存储。

1)头文件[.hea]

第一行为记录行,包含两个采样率为360Hz的信号,每一信号的长度为65万个采样点。

后面紧跟的两行是信号技术规范说明行,从中可以看出,两个信号都包含在文件格式100.dat中,每一信号都是以12位的位压缩格式(即“212”格式)进行存储的,两个信号的增益都是每200ADC uints/mV,ADC的分辨率为11位,ADC零值为1024。两个信号的第一采样点的值分别为995和1011,65万个采样点的校验数分别为-22131和20052,输入输出可以以任何尺寸的块来执行,因为文件内容说明了这两个信号的该值都为0,信号描述字段说明了这两个信号分别采自MLII导联和V5导联。

文件的最后两行包含了注释字符串,其中第一行说明了患者的年龄和性别以及记录数据,第二行列出了患者的用药情况。

信号增益:放大倍数
每200ADC uints/mV 每200值为1mV
ADC:Analog digital convter,模拟数字信号转换

2)数据文件[.dat]

MIT-BIH数据库中的数据存储格式有Format8、Format16、Format80、Format212、Format310等8种,心律失常数据库统一采用212格式进行存储。
“212”格式是针对两个信号的数据库记录,这两个信号的数据交替存储,每三个字节存储两个数据。

以100.dat为例,每三个字节(24位)表示两个值,第一组为“E3 33 F3”,两个值则分别为 0x3E3 和 0x3F3转换为十进制的995和1011,代表的信号幅度分别为4.975mV和5.055mV,这两个值分别是两个信号的第一采样点,后面以此类推,分别表示了两个信号的采样值。

3)注释文件[.atr]

记录了心电专家对相应的心电信号的诊断信息,主要有两种格式:MIT格式和AHA格式。若文件的第一字节不为0或第二字节等于“[”(0x5B)或“]”(0x5D),则该文件是以MIT格式存储的,否则是按AHA格式存储的。
以100.atr为例,从文件中的第一字节不为0可以判断该文件是以MIT格式存储的。从第一字节开始首先读出16位值 0x7012,其高6位的值为0x1C(十进制28),低10位的值为0x12(十进制18),该类型代码为28,代表意义是节律变化,发生时间在0.05秒(18/360Hz);接着读出后面的16位值0xFC03,其高6为的值为0x3F(十进制63),低10位的值为0x03(十进制3),该类型代码为63,代表的意义是在该16位值后附加了3个字节的辅助信息,若字节个数为奇数,则再附加一个字节的空值,在本例中就是“28 4E 00 00”;然后再从下一字节读16位值0x043B,其高6位的值为1,低10位的值为0x3B(十进制59),该类型码1代表正常心搏,发生时间为0.214秒((18+59)/360Hz);依次类推即可读出所有的注释,当读到的16位值为0时,就表示到了文件尾。

注释:

16进制0x7012 转二进制 0111 0000 0001 0010,其高6位 0111 00 前面补0得到 0001 1100,再转十六进制 0x1C,对应十进制为 1*16^1 + 12 *16^0 = 16+12=28。低10位 00 0001 0010 补0后 0001 0010,再转十六进制不变 0x12,对应十进制 1 *16^1 + 2 *16^0 = 16+2=18

 

kaggle上[.csv]格式的数据集

数据集地址

1)数据文件[.csv]:展示数据文件,值分别为两通道数据转为十进制的值,代表的信号幅度为“x*0.005mV”。

 

2)注释文件[annotations.txt]:txt格式下的注释文件,“N”表示正常,“A”表示房性早搏。


 

4. Symbols说明

数据集中心跳类型简写所代表的具体含义,包括心跳 beats 和心律 rhythms。

补充说明:

房性早搏(心室搏动还未结束心房就开始搏动)

室上性早搏(发生于心房或者房室结的统称为室上性,室上性早搏,是说早搏介于房性和室性之间,属于轻微的心率失常)

Symbol符号表

SymbolMeaningNoting
· or NNormal beat正常心跳
LLeft bundle branch block beat左束支传导阻滞
RRight bundle branch block beat右束支传导阻滞
AAtrial premature beat房性早搏
aAberrated atrial premature beat异常房性早搏
JNodal (junctional) premature beat交界性早搏
SSupraventricular premature beat室上性早搏
VPremature ventricular contraction室性早搏
FFusion of ventricular and normal beat心室搏动与正常搏动融合
[Start of ventricular flutter/fibrillation开始心室扑动/纤颤
!Ventricular flutter wave心室颤振波
]End of ventricular flutter/fibrillation心室扑动/颤动结束
eAtrial escape beat房性逸搏
jNodal (junctional) escape beat交界性逸搏
EVentricular escape beat室性逸博
/Paced beat起博心跳
fFusion of paced and normal beat起搏融合心跳
xNon-conducted P-wave (blocked APB)非传导P波(APB阻塞)
QUnclassifiable beat无法分类的心跳
|Isolated QRS-like artifact独立的伪QRS波群
------------------Rhythm annotations appear below the level used for beat annotations:Rhythm注释出现beats注释的级别下方:
(ABAtrial bigeminy房性早搏二联律
(AFIBAtrial fibrillation房颤
(AFLAtrial flutter心房震颤
(BVentricular bigeminy室性二联
(BII2° heart block2°心脏传导阻滞
(IVRIdioventricular rhythm室性节律
(NNormal sinus rhythm正常窦性心律
(NODNodal (A-V junctional) rhythm房室结交界性心律
(PPaced rhythm起搏心律
(PREXPre-excitation (WPW)
(SBRSinus bradycardia窦性心动过缓
(SVTASupraventricular tachyarrhythmia室上性快速性心律失常
(TVentricular trigeminy心室三叉神经
(VFLVentricular flutter心室扑动
(VTVentricular tachycardia室性心动过速
-----------------Signal quality and comment annotations
appear above the level used for beat annotations:
信号质量和评论注释出现 在beats注释级别之上
qqSignal quality change: the first character (c' orn’)
indicates the quality of the upper signal (clean or noisy),
and the second character indicates the quality of the lower signal
信号质量变化:第一个字符(“ c”或“ n”)
表示较高信号的质量(干净或有噪声),
第二个字符表示较低信号的质量
UExtreme noise or signal loss in both signals: ECG is unreadable两种信号的极端噪声或信号丢失:ECG不可读
M (or MISSB)Missed beat漏掉的节拍
P (or PSE)Pause暂停
T (or TS)Tape slippage磁带打滑

 

5. Records说明

Records

本节包含说明每个记录内容的注释和统计信息。在记录编号之后立即为每条 record 提供用于upper 和 lower信号的导联。在每条记录的前五分钟和记录的其余部分(EC38分别定义的 learning 和 test 时期)给出 beat 节拍计数。请注意,对于那些发生次数很少的记录,总数包括两种类型的非搏动(阻塞的APC和心室扑动波)。每条记录的总持续时间为30分5.556秒;下面指出的持续时间四舍五入到最接近的秒数,由于累积的舍入误差,可能不能精确地等于30:06。心率以每分钟的心跳数为单位,在3个R-R间隔内测量。

记录100 (MLII,V5;男性,69岁)

*药物:*Aldomet 爱道美片,Inderal

Beats 节拍5:00之前5:00之后总和
正常36718722239
APC42933
PVC11
总和37119022273

室上性异位 Supraventricular ectopy

  • 33个独立节拍
RhythmRateEpisodes持续时间
正常窦性心律70-891个30:06
信号质量Episodes持续时间
Both clean1个30:06

兴趣点:

11:03 正常窦性心律 Normal sinus rhythm
25:13 PVC
26:09 APCs
27:55 正常窦性心律

 
Record 101 (MLII, V1; female, age 75)

Medications: Diapres

BeatsBefore 5:00After 5:00Total
Normal34215181860
APC-33
Unclassifiable-22
Total34215231865

Supraventricular ectopy

  • 3 isolated beats
RhythmRateEpisodesDuration
Normal sinus rhythm55-79130:06
Signal qualityEpisodesDuration
Both clean330:01
Upper noisy10:04
Unreadable10:01

兴趣点:

1:34 Normal sinus rhythm
1:48 Noise
5:13 Noise/artifact 噪声/伪像
9:54 APC
24:32 APC

 

6. Tables of beats and rhythms

Tables of beats and rhythms

前两个表完整列出每半个小时记录的 beat 类型和 rhythms。

最后两个表显示相同的信息,但仅适用于EC38定义的“测试期间’’(即,不包括每个记录的前五分钟)。

心跳表的列标题显示AHA注释代码(N,V,F,E,P,Q和O),在此目录中其他位置用于数据库注释的符号上方。有关这些符号的完整列表以及用作节奏表的列标题的缩写,请参见 符号

心跳表显示每个记录中每种类型的心跳节拍数。心律表以分钟和秒为单位显示在每个记录中观察到的每个心律的总持续时间(四舍五入到最接近的秒)。

  • 心跳类型表(全部记录)

  • 心律表(全部记录)

  • 心跳类型表(仅测试阶段)

  • 心律表(仅测试阶段)

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MIT-BIH QT数据库是一种包含人类心电图数据的公开数据库,用于研究心脏的电生理特征和心脏疾病的识别与分析。该数据库由麻省理工学院(MIT)和美国国立卫生研究院(NIH)的比坚锡医院(BIH)合作创建,并于1980年发布。 MIT-BIH QT数据库主要包含来自多个健康志愿者和心脏病人的心电图信号,总计500个记录。这些心电图记录在不同的情况下采集,包括静息、运动、药物影响等等。在记录过程中,心电图信号被模拟器进行测量,并通过标准12导联记录,以及记录人员的相关生理和临床信息。 MIT-BIH QT数据库的主要目的是提供一个对心脏r波的测量结果进行快速和可靠分析的参考标准。研究人员可以利用这一数据库来开发和验证心脏疾病的自动识别算法,以及其他相关的心脏研究。 对于心脏病学和生物医学工程学领域的研究人员来说,MIT-BIH QT数据库是一个非常有价值的资源。它为研究心脏疾病的机理、心脏节律障碍和药物对心电图的影响提供了丰富的数据。通过分析和处理MIT-BIH QT数据库中的心电图信号,研究人员可以进一步理解心脏的电生理过程,并且为心脏疾病的诊断和治疗提供更多的依据。 总之,MIT-BIH QT数据库是一个被广泛应用于心脏研究的公开数据库,它对于研究人员来说是一个宝贵的资源,可以帮助他们深入了解心脏疾病的机理和识别方法。

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