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RSS订阅原创 Linux与生物信息（第一章——Linux常用命令3）
2 进程管理2.1进程查看2.1.1 ps(process status)功能说明：显示用户进程语 法：ps x [-u ]参 数：-u 显示usr用户的进程（默认显示自身用户进程）Example ：ps x2.1.2 top功能说明：显示用户进程（实时）语 法：top [-bcdu]参 数：-b 批处理模式，可以将top内容重定向到文件中-c 显示详
2017-05-31 16:29:34
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原创 linux下FTP、SFTP命令详解
FTP> ! 从 ftp 子系统退出到外壳。FTP> ? 显示 ftp 命令说明。? 与 help 相同。格式：? [command]说明：[command]指定需要帮助的命令名称。如果没有指定 command，ftp 将显示全部命令的列表。 FTP> append 使用当前文件类型设置将本地文件附加到远程计算机上的文件。格式：append
2017-05-30 22:04:46
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原创 Linux里如何查找文件内容
从文件内容查找匹配指定字符串的行：$ grep "被查找的字符串" 文件名例子：在当前目录里第一级文件夹中寻找包含指定字符串的.in文件grep "thermcontact" */*.in从文件内容查找与正则表达式匹配的行：$ grep –e “正则表达式” 文件名查找时不区分大小写：$ grep
2017-05-30 22:02:22
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原创 R语言绘制热图——pheatmap
pheatmap: Pretty Heatmaps——Implementation of heatmaps that offers more control over dimensions and appearance.library(pheatmap)#创建数据集test测试矩阵test = matrix(rnorm(200), 20, 10)test[1:10, seq(1, 10,
2017-05-26 15:24:35
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原创 Linux与生物信息（第一章——Linux常用命令2）
1.3 压缩解压缩1.3.1 tar功能说明：加入或还原备份文件内的文件语 法：tar -f[cxzjv] 参 数：-f 必加参数-c 创建备份文件-x 从备份文件中还原文件-z 调用gzip/gunzip来压缩/解压缩文件-j 调用bzip2/bunzip2来压缩/解压缩文件-v 显示命令执行过程Example
2017-05-26 15:17:18
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原创 Linux与生物信息（第一章——Linux常用命令）
（网易云课堂，腾讯课堂生物信息讲师，高级生物信息工程师）第一章——Linux常用命令1. 目录和文件管理1.1目录相关1.1.1 mkdir功能说明：建立目录语 法：mkdir [-p] 参 数：-p 若所要建立目录的上层目录目前尚未建立，则会一并建立上层目录。Example ：mkdirtestdirmkdir -p n
2017-05-26 15:11:10
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原创 RCircos绘制圈图（2）
#导入内建人类染色体数据data(UCSC.HG19.Human.CytoBandIdeogram);head(UCSC.HG19.Human.CytoBandIdeogram); chr.exclude cyto.info tracks.inside tracks.outside #导入上面四个基本参数 RCircos.Set.Core.Co
2017-05-24 17:36:03
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原创 RCricos绘制圈图（1）
library(RCircos)#导入内建人类染色体数据data(UCSC.HG38.Human.CytoBandIdeogram)cyto.info <- UCSC.HG38.Human.CytoBandIdeogramRCircos.Set.Core.Components(cyto.info, chr.exclude=NULL,tracks.inside=10, tracks.ou
2017-05-24 17:33:24
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原创 Python或者R语言出现中文字体乱码的情况
在用Python和RStudio加载上文链接提供下载的编程代码时，出现提示“Not all characters in E:/a.txt could be decoded using CP936."cp936 的意思是 Codepage 936, 是简体中文的编码。此外，中文字符集编码还包括：Unicode ,GB2312 ,GBK，GB18030，UTF-8等。U
2017-05-24 14:52:06
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原创 R语言多重线性回归错误分析：Error in model.frame.default
Error in model.frame.default(Terms, newdata, na.action = na.action, xlev = object$xlevels) : 因子factor(o)里出现了新的层次设置train和test时保证test and train 数据集要有相同的因子水平。简言之，各因子水平要同时存在test and train 里。否则你再怎么查资料，重写
2017-05-22 21:44:02
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原创 R语言绘图实战：RDA冗余分析
#载入vegan包library(vegan)#读取“样本-物种”文件sp <- read.table(file=file.choose(),sep="\t",header=T,row.names=1)sp#读取“样本-环境因子”文件se <- read.table(file=file.choose(),sep="\t",header=T,row.names=1)se#选择用RDA
2017-05-13 10:36:24
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原创 16S rRNA&rDNA测序分析
16SrRNA/rDNA测序分析，qiime操作，linux命令，系统发育树构建，venn图，heatmap热图，主分析RDA（Redundancyanalysis），典范对应分析CCA等R语言作图网易云课堂上有视频讲解。16S rRNA&rDNA测序分析第一节-OTU概述-qiime安装1.1 16s 测序16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚
2017-05-13 10:12:51
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生物信息学数据处理
2017-05-10
Python机器学习machine learning in python.pdf
2017-04-04
Python数据分析Python for Data Analysis.pdf
2017-04-04
空空如也
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