starbase 数据库使用 （miRNA预测LncRNA）

最新推荐文章于 2024-10-29 10:01:46 发布
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分类专栏： 生信分析 文章标签： 经验分享
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本文链接：https://blog.csdn.net/sjdaisy/article/details/123711604
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本文介绍了如何通过ENCORI数据库查询miRNA与LncRNA的相互作用，具体步骤包括选择miRNA-LncRNA交互，输入物种（如mouse）和特定miRNA（如mmu-miR-707），并下载预测结果到Excel文件。
摘要由CSDN通过智能技术生成

数据库网址：ENCORI: The Encyclopedia of RNA Interactomes.

ENCORI: The Encyclopedia of RNA Interactomes.

1. 打开链接，看到数据库首页

 2.点击‘miRNA  target’ 下拉按钮，选择miRNA-LncRNA,如下图

 3. 点击后可见如下见面：

 4. 物种选择‘mouse’，‘microRNA’ 输入待查的miRNA，如mmu-miR-707，enter键确定

 5. 得到结果如上图，上面一栏，可以再次确认物种选择：mouse，输入的miR为mmu-miR-707，红色框4 代表即代表预测到的结果

6.  右击右侧上角‘download--Excel’选择将连接另存为，即可下载保存所以预测结果

 

 

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