conda activate base
sudo apt update
sudo apt upgrade
sudo apt install ncbi-blast+
makeblastdb
1.链接
Zlib
libpng
https://sourceforge.net/projects/libpng/files/
MCScanX--github
https://github.com/wyp1125/MCScanX?tab=readme-ov-file
若无法访问
Windows系统打开cmd
ping github.com
打开C:\Windows\System32\drivers\etc路径找到hosts文件,右键用记事本打开,在最下面的空行粘贴ip地址,并加上github域名(ip和域名之间有空格)
保存
若无法保存,显示需管理员权限
在Windows搜索栏中输入“记事本”,右击“记事本”,选择“以管理员身份运行”
2.Zlib库、libpng库、MCScanX安装包
通过百度网盘分享的文件:MCScanX
链接:https://pan.baidu.com/s/13CP8eLZSbOl70a93SkWymQ?pwd=pb6t
提取码:pb6t
tar -zxvf zlib-1.3.1.tar.xz
tar -zxvf libpng-1.6.37.tar.gz
unzip MCScanX-master.zip
cd zlib-1.3.1 #Zlib
./configure
make
make install
报错
sudo make install
cd
cd libpng-1.6.37 #libnpg
./configure
make
sudo make install
cd
cd MCScanX-master #MCScanX
vim msa.h
#1.在开头添加#include <unistd.h> 2.:wq保存退出
make
echo 'PATH=$PATH:~/MCScanX-master/' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
MCScanX