终于弄好TCGAbiolinks包的安装,太难了

本文讲述了R新手在尝试安装TCGAbiolinks包时遇到的各种问题,包括直接安装失败、从Bioconductor下载和配置CRAN仓库的挑战,最终通过删除安装记录、连接VPN并使用BiocManager进行版本管理才成功。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

R小白,弄了很久,终于把TCGAbiolinks包加载好了

试了很多种方法都报错了

1、直接install.packages("TCGAbiolinks")不行

2、从bioconductor下载R包,本地安装,弹出这个


3、getOption("repos")
options(repos=c(CRAN="@CRAN@",
                CRANextra="http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"))

BiocManager::install("TCGAbiolinks")

都不行

最后是把R包的安装记录删除,连接VPN

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version='devel')

BiocManager::install("TCGAbiolinks")
library(TCGAbiolinks)

这个安装才成功,

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