R语言常用函数和常见错误

xlsx包安装报错

错误: 无法载入共享目标对象‘C:/Users/ASUS/Documents/R/win-library/3.6/rJava/libs/x64/rJava.dll’：:

Sys.setenv(JAVA_HOME='C:\\Program Files\\Java\\jre1.8.0_251')## 后面的链接是jre的目录

这个报错是R语言找不到安装的jre目录

write.table

1. 如何让输出的字符串不带引号
   1. quote参数设置为F

paste0

1. 将输入自动转化为字符串并连接起来，如果输入的是两个向量，会先使用转化为字符型向量，然后逐项连接起来

   paste0(c(1,2,3),c(3,4,5))
   #结果：[1] "13" "24" "35"
   

2. collapse参数规定每两个结果之间的分隔形式

   paste0(c(1,2,3),c(3,4,5),sep="",collapse = "\n")
   #结果：[1] "13\n24\n35"
   

如何将表格中某列元素相等的行取出来

有时候我们需要按照某一列的元素对表格进行分割，将该列元素相等的行做上相同的记号，这个时候使用什么方法好呢？

## 首先取到相同探针的行号
index <- unique(blastProbeName)
loc <- match(blastProbeName,index)

这里的blastProbeName就是我们需要用来分割的列

我们只要先把这个向量去重复，然后再用原来的向量和去重复后的向量进行匹配，就能得到根据这个向量分割的标志了

例如，输入的向量是：c(1,2,2,3,3,5)

去重复后的向量是：c(1,2,3,5)

输出的向量是: c(1,2,2,3,3,4)

表达谱重复基因用平均值替代

library(limma)
expr = avereps(expr[,-1],ID = expr$X) # expr是表达谱矩阵

duplicate函数和unique函数

• unique：返回一个没有重复元素的向量
• duplicate：判断向量中每个元素是否重复，注意的是，重复元素第一次出现的时候判断为false

R语言 管道

• %>% 是dplyr包的一个函数，作用就是将上一步的结果向下传递。
• 示例：