生物信息学入门 根据表达矩阵和差异表达基因列表制作差异表达矩阵

根据表达矩阵做完差异分析之后，就要将差异表达基因的表达情况从表达矩阵中提取出来，制作差异表达矩阵。这个过程非常简单，但是也有一些人问到，就整理了这个教程。

1. 数据准备：原始表达矩阵和差异表达基因

这是原始矩阵

这是差异基因列表

2.  Vlookup函数匹配

Vlookup函数是Excel中数据匹配的常用函数

首先插入一列

做个标记

插入新的一列

输入函数，函数有四个参数，第一个是匹配特征，此处为基因名称

匹配范围

因为1在第二列，所以第三个参数是2

第一个不在差异表达基因列表里，所以是NA，双击右下角填充

筛选将匹配到1的选出来，就是差异表达列表里的基因了

复制到新的Excel表，存放成csv格式，就可以绘制热图了。

GEO芯片数据差异表达分析时需要log2处理的原因

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差异表达矩阵制作教程

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差异表达的热图绘制详见

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