2020年08月_wangchuang2017

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原创认识SCI、EI、SSCI、IEEE、CSSCI、CSCD

认识SCI、EI、SSCI、IEEE、CSSCI、CSCD日期：2018-11-01 00:00:00 浏览量：39SCI SCI(科学引文索引)、EI(工程索引)、ISTP(科技会议录索引)是世界著名的三大科技文献检索系统，是国际公认的进行科学统计与科学评价的主要检索工具其中以SCI最为重要。《科学引文索引》(Science Citation Index,SCI)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库，其覆盖生命科学、临床医学、物理化学、农业、...

2020-08-30 09:54:48 1828

原创《开源者说》08期：聊聊Java那些事儿

《开源者说》08期：聊聊Java那些事儿发表于2015-06-10 18:23| 4388次阅读| 来源CSDN| 28条评论| 作者陈秋歌 Java开源者说陈阳宫力许斌摘要：2015年5月23日，Java迎来了它的20岁生日。为此，我们邀请了北京GNOME用户组创办人陈阳、前美国Mozilla公司全球总裁宫力、清华大学计算机科学与技术系副教授许斌，一起聊聊他们与Java之间的那些事儿。关于《开源者说》：《开源者说》由CSDN推出，目的是为开源社区人士提供一个展示平台，推动国内开源社区..

2020-08-30 09:52:21 191

原创 JSP技术

JSP技术日期：2015-06-15 15:59:39 浏览量：64 JSP是一种建立在Servlet规范提供的功能之上的动态页面技术，JSP文件在用户第一次请求时，会被编译成Servlet，然后由这个Servlet处理用户的请求，所以JSP也可以看成是运行时的Servlet。JSP和Servlet的区别是什么呢？Servlet是Java对CGI的回应，它们在服务器上执行和解释浏览器的请求，承担客户端和其他应用程序之间的中间层的角色。Servlet主要是把动态的内容混合到...

2020-08-30 09:49:22 210

原创 Performance difference of graph-based and alignment-based hybrid error correction methods for error-

Jan 17th, 2020: New Publications.Performance difference of graph-based and alignment-based hybrid error correction methods for error-prone long reads.Wang, A.,Au, K.F.Genome Biology.2020. [Manuscript]Performance difference of graph-based and alignmen..

2020-08-29 17:03:47 163

原创 Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs

Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphsAbstractThe error-prone third-generation sequencing (TGS) long reads can be corrected by the high-quality second-generation sequencing (SGS) short reads, which is referred to as hyb

2020-08-29 16:33:53 176

原创单分子测序技术精准解析复杂结构变异

单分子测序技术精准解析复杂结构变异发表期刊：Nature Methods2018年8月，来自美国的研究团队基于三代测序读长较长的特性，利用基因组比对工具NGMLR和结构变异识别工具Sniffles，对已发表的Illumina、PacBio以及Nanopore人基因组测序数据进行了系统地分析。研究结果表明相对于以往的分析工具，NGMLR和Sniffles是一组高效的适用于长读长的变异检测工具，结合PacBio长读长测序的优势能够为结构变异的检测提供了前所未有的灵敏度和精确度，即使在重复序列区域及复

2020-08-29 16:24:23 626

原创 PacBio软件总览 - 初级分析

PacBio软件总览 - 初级分析PacBio® RS Software OverviewPacBio运行的整个流程是什么？每一步都用到了什么软件？PacBio软件套件RS Remote：Design runs remotely，Can assign multiple SMRT® Cells per well with different movie timesRS Touch：Loading a Run，Monitor at the instrument or remotely，

2020-08-29 16:22:23 351

原创 SMAT,PacBio

SMAT,PACbioCs_mary2017-03-22 11:48:45744收藏分类专栏：BioInfo版权PacBio PacBio测序平台基于其独特的单分子实时测序技术（Single Molecule Real Time，SMRT），通过其超长读长，均一的覆盖度，高度的一致性准及确性提供无与伦比的遗传信息深度解析。该技术帮助科学家获得超越碎片化的基因组草图，得到最完整的从头组装结果，已经使许多极富挑战性的基因组学研究成为可能。Pacific Biosciences...

2020-08-29 16:19:31 210

原创 PacBio软件总览 - 初级分析

PacBio软件总览 - 初级分析weixin_306992352016-12-08 16:19:0040收藏版权PacBio® RS Software OverviewPacBio运行的整个流程是什么？每一步都用到了什么软件？PacBio软件套件RS Remote：Design runs remotely，Can assign multiple SMRT® Cells per well with different movie timesRS Touch：L...

2020-08-29 16:15:41 380

原创 Comprehensive assessment of error correction methods for high-throughput sequencing data

Comprehensive assessment of error correction methods for high-throughput sequencing dataYun Heo,Gowthami Manikandan,Anand Ramachandran,Deming ChenThe advent of DNA and RNA sequencing has revolutionized the study of genomics and molecular biology. Ne...

2020-08-29 16:14:04 118

原创 Comprehensive comparison of Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies and their applicati

Comprehensive comparison of Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies and their applications to transcriptome analysis综合比较太平洋生物科学和牛津纳米孔技术及其应用转录组分析Background:Given the demonstrated utility of Third Generation Sequencing [Pacific Bioscience.

2020-08-29 12:18:43 408

原创 PacBio Sequel概述

PacBio Sequel概述概述近年来，以PacBio测序为代表的第三代基因测序技术逐渐兴起。美国太平洋生物科学公司推出的三代测序又称作SMRT测序，即单分子实时测序，该方法基于纳米小孔的单分子读取技术，无需扩增即可快速完成序列读取。三代测序被广泛应用于基因组研究中始于2013年PacBio成功推出商业化的三代测序仪PacBio RSII。经过不断的改良和升级，PacBio公司在2015年10月推出全新升级的三代测序仪PacBio Sequel测序系统，其具有的长读长、高通量、高准确率等特点定将为

2020-08-11 17:57:55 5434