加载org.Hs.eg.db为什么出现error: $ operator is invalid for atomic vectors报错和解决方法

最新推荐文章于 2024-03-19 16:01:22 发布
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分类专栏： Rdebug 文章标签： R debug
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在Bioconductor上已经有人提了问题，并且有了回答（地址：https://support.bioconductor.org/p/9136329/）

简单的说，就是Rstduio出来背锅，最新的RSQLite(v2.2.6)和Rstudio存在冲突，以后要么是RSQLite迁就RStduio，要么就是Rstudio迁就RQLite。

不过目前也不是不能用，以下是解决方法

方法1 手动设置环境变量

options(connectionObserver = NULL)

方法2: 装个旧版本RSQLite，2.2.5之前即可

install.packages("remotes")
remotes::install_version("RSQLite", "2.2.5")

对于windows用户，旧版本的编译需要Rtools，如果嫌麻烦，我手头存了一份已经编译好的版本，因此可以直接用下面的命令安装

install.packages("http://xuzhougeng.top/static/RSQLite_2.2.1.zip",repos = NULL, type = "binary")
徐洲更hoptop
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