RDKit | 比较分子之间的相似性

最新推荐文章于 2025-06-09 09:19:48 发布

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分类专栏： RDKit | 化学信息学与AI 文章标签： RDKit 化学信息学 Python

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本文介绍了如何使用RDKit库在Python中进行分子相似性比较。通过将SMILES字符串转化为RDKit分子对象，并进行相似性计算，可以评估不同分子的结构相似度。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

比较分子之间的相似性

获取结构和数据，将SMILES转换为RDKit分子对象，然后比较相似性。

1.导入python模块

import numpy as np
import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib as plt
from rdkit.Chem import AllChem as Chem
from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
from rdkit.Chem import PandasTools
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit import DataStructs
%matplotlib inline

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