Bioinformatics Armory第4题:GenBank Introduction

Problem

GenBank can be accessed here. A detailed description of the GenBank format can be found here. A tool, from the SMS 2 package, for converting GenBank to FASTA can be found here.

Given: A collection of  () GenBank entry IDs.

Return: The shortest of the strings associated with the IDs in FASTA format.

可以在这里访问GenBank 。有关GenBank格式的详细说明,请参见此处。所述的工具,从SMS 2包,用于GenBank中转换成FASTA可以找到这里

鉴于:的集合 ()GenBank条目ID。

返回值:FASTA格式的ID相关联的最短字符串。

 

Sample Dataset

FJ817486 JX069768 JX469983

Sample Output

>JX469983.1 Zea mays subsp. mays clone UT3343 G2-like transcription factor mRNA, partial cds
ATGATGTATCATGCGAAGAATTTTTCTGTGCCCTTTGCTCCGCAGAGGGCACAGGATAATGAGCATGCAA
GTAATATTGGAGGTATTGGTGGACCCAACATAAGCAACCCTGCTAATCCTGTAGGAAGTGGGAAACAACG
GCTACGGTGGACATCGGATCTTCATAATCGCTTTGTGGATGCCATCGCCCAGCTTGGTGGACCAGACAGA
GCTACACCTAAAGGGGTTCTCACTGTGATGGGTGTACCAGGGATCACAATTTATCATGTGAAGAGCCATC
TGCAGAAGTATCGCCTTGCAAAGTATATACCCGACTCTCCTGCTGAAGGTTCCAAGGACGAAAAGAAAGA
TTCGAGTGATTCCCTCTCGAACACGGATTCGGCACCAGGATTGCAAATCAATGAGGCACTAAAGATGCAA
ATGGAGGTTCAGAAGCGACTACATGAGCAACTCGAGGTTCAAAGACAACTGCAACTAAGAATTGAAGCAC
AAGGAAGATACTTGCAGATGATCATTGAGGAGCAACAAAAGCTTGGTGGATCAATTAAGGCTTCTGAGGA
TCAGAAGCTTTCTGATTCACCTCCAAGCTTAGATGACTACCCAGAGAGCATGCAACCTTCTCCCAAGAAA
CCAAGGATAGACGCATTATCACCAGATTCAGAGCGCGATACAACACAACCTGAATTCGAATCCCATTTGA
TCGGTCCGTGGGATCACGGCATTGCATTCCCAGTGGAGGAGTTCAAAGCAGGCCCTGCTATGAGCAAGTC
A
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