monocle 2.24.1 orderCells() 函数报错问题

原函数包自身的问题罢了,解决办法也很简单:

1.下载一个2.24.0版本的gz.tar: https://www.bioconductor.org/packages/3.15/bioc/src/contrib/Archive/monocle/

2. 解压出一个monocle文件夹,里面找到/monocle/R/order_cell.R函数文件,打开编辑

3.删掉下文中的一行

if(class(projection) != 'matrix')
projection <- as.matrix(projection)

改为

projection <- as.matrix(projection)

保存替换原文件

4.用7-Zip软件把monocle 文件夹重新压缩,先压成.tar,再把.tar文件压成.tar.gz。

5.R studio 本地安装新包。

#还有什么问题可以参考这个帖子:

what is the "condition" in orderCells() function · Issue #434 · cole-trapnell-lab/monocle-release · GitHub

  • 12
    点赞
  • 5
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 14
    评论
评论 14
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值