生物信息学基础(包括Perl)

1.生物信息学:将计算机科学和数学应用于生物大分子信息的获取、加工、存储、分类、检索与分析,以达到理解这些生物大分子信息的生物学意义的交叉学科。

2.基本方法:

搜索数据库(Blast、Blat)

序列分析(比对、注释、找Gene)

统计分析(隐马尔可夫模型HMM、贝叶斯分析模型)

算法(遗传算法、人工神经网络)

数学模型(确定性模型、随机模型)

3.Perl是脚本语言,内部集成了正则表达式的功能以及巨大的第三方代码库CPAN。文本处理强大,模式匹配(正则表达式)

4.简单变量:整型(最常用)  $x=10

                 浮点数:11.4,-0.9,54.1e+2,3.2e09     $value = 9.01e+21 + 0.01 -9.01e+21;

              字符串:$number = 11;$text =“This text contains the number $number.”;则$text的内容为:“This text contains the number 11.”                       特殊字符串:\n: 回车换行                   \t: 制表符Tab

5.操作符:

5.1算术操作符:+ - * / % **(乘幂)  -(单目负)

5.2整数比较操作符:<   >   ==   <=    >=     !=      <=&g

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