计算机辅助多肽设计,基于BRC8的新型多肽理性设计及其与靶肽相互作用性质研究...

摘要：

BRCA2是一种重要的抑癌基因,与多种癌症的发生关系密切,同时在保持基因的稳定性方面起着重要作用.BRCA2的八个重复基元(BRC)能够与RAD51蛋白作用,进而影响单链DNA损伤修复.因此,研究BRC与RAD51的相互作用具有重要的意义.本论文基于BRC8一级结构,通过计算机辅助模拟使用ZDOCK分子对接得到BRC8与RAD51蛋白的可能的结合模式,使用虚拟丙氨酸扫描多肽找到潜在的活性位点,并以此为依据设计了14条类BRC8肽;进而通过Fmoc固相合成法对其中的6条多肽以及BRC8,靶肽进行了合成,纯化,并对产物表征,共得到8条纯度均大于85%的多肽.利用圆二色光谱法研究了BRC8以及6条类肽与靶肽RAD51(231-260)的相互作用.使用圆二色分析软件CDPro分析靶肽与类肽作用后的靶肽二级结构的变化:发现类肽BRC8-1,BRC8-3,BRC8-6与RAD51(231-260)相互作用后,RAD51(231-260)的α-helix分别增加了23.6%,15.1%,13.5%,因此推测这三条类肽较之于母肽BRC8与RAD51(231-260)发生了较强的相互作用.

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