相关性分析p值_TCGA|GEO可视化分析第1篇---相关性分析

最新推荐文章于 2024-05-06 15:37:05 发布
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文章标签： 相关性分析p值
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本文介绍了如何进行基因相关性分析，通过实例展示了使用COX1和ATP6进行相关性分析的过程，揭示两者存在正相关但相关系数较低。同时，文章提到了使用ggcorrplot绘制所有基因间的相关性图，并指出P值小于0.05表示显著相关。
摘要由CSDN通过智能技术生成

导读：今天有小伙伴问我，筛选完差异基因后，想看自己关注的基因和其他基因的关系，应该怎么做？那当然要先做一下相关性分析了！好，下面让我给大家娓娓道来......

正文：

step1：我们先读取下所需要的数据

library(openxlsx)
setwd("E:Bioinfo_analysisscriptscorrcorr_batch") #设置工作路径
fr<-read.xlsx('infile.xlsx',rowNames = T,colNames = T)
View(fr) #查看下数据类型，列名基因名，行名为样本名

9b81d0c7026d7eef8f305adcf33d9f96.png

Step2：下载安装包

library("ggstatsplot") #加载包的时候失败了，因为之前没有安装这个包
library("BiocManager") 
BiocManager::install("ggstatsplot") #安装ggstatsplot,要安装很多依赖包，泡杯咖啡，静静的等着它

差不多花了30分钟才把所有的包安装完，下面开始进行相关性分析&

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