关于BiocManager更新

最新推荐文章于 2023-02-16 22:40:01 发布

weixin_30420305

最新推荐文章于 2023-02-16 22:40:01 发布

阅读量1.4k

点赞数 1

文章标签： r语言

原文链接：http://www.cnblogs.com/wwdPeRl/p/11434951.html

版权

这几天发现我的BiocManager使用不了了:

Bioconductor version '3.8' is out-of-date; the current release version '3.9' is available with R version '3.6'

一直提示这个问题,后来我在github的项目 issue里找到了解决方式

BiocManager::install(version="3.9")

Bioconductor的官网都没有这个更新的信息...

转载于:https://www.cnblogs.com/wwdPeRl/p/11434951.html

确定要放弃本次机会？

福利倒计时

: :

立减 ¥

普通VIP年卡可用

立即使用

weixin_30420305

关注关注

1
点赞
踩
0

收藏

觉得还不错? 一键收藏
0
评论
复制链接

分享到 QQ

分享到新浪微博

扫一扫

关于BiocManager下载包失败的情况（持续更新）

m0_53065601的博客

03-15

4185

biocmanage下载失败尝试重新

BiocManager安装R包失败——Bioconductor version cannot be validated

wyhua2008的博客

07-29

1125

最近因为需要安装ChIPseeker这个R包，需要使用BiocManager进行安装。前言1. 报错内容2. 解决方案3. 安装R包模板3.1 镜像设置3.2 下载方式设置3.3 安装R包4. 永久保存镜像设置后记。为了更方便的安装R包，不用每次都进行设置。这样以后我们一旦打开R软件，这些代码就会自动运行一次，我们就可以愉快的安装R包了。代码语言：javascript。代码语言：javascript。代码语言：javascript。代码语言：javascript。代码语言：javascript。

参与评论您还未登录，请先登录后发表或查看评论

BiocManager的安装、更新

热门推荐

x_yAOTU的博客

03-11

3万+

BiocManager的安装、更新

conda安装R包（拒绝BiocManager更新）

wangyiqi806643897的专栏

06-01

2170

不想用BiocManager安装更新怎么办？

如何更新已安装过的Bioconductor软件包？

weixin_59289660的博客

08-05

5128

的“Update Installed。

R语言笔记——”org.Hs.eg.db“脱坑记录

努力努力努力再努力

08-19

9359

R语言笔记——”org.Hs.eg.db“脱坑记录 ”org.Hs.eg.db“是发布在bioconductor平台上面的一个数据库文件，该包中装有较多的主流数据资料文件，但是小编在安装该包的过程中遇到了一些问题，通过浏览各大平台的资料以及自己实操，现已解决”org.Hs.eg.db“包的安装问题，接下来对于该包安装过程中遇到的问题进行简要分享。 1."BiocManager"包下载"BiocManager"包中的问题 if (!requireNamespace("BiocManager", qu

R包安装问题合集

weixin_42960896的博客

08-30

2019

如果R包安装没有提示error，却又安装失败了，那就需要审视一下是不是有其他提示信息了：例如: 其实说的很清楚，需要下载Rtools，但给出的地址是官网地址，下载速度很慢，我们可以用镜像代替： https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/Rtools/ 100多兆，飞一般的速度！ ...

下载ｂｉｏｃｍａｎａｇｅｒ

09-02

- *3* [关于BiocManager下载包失败的情况（持续更新）](https://blog.csdn.net/m0_53065601/article/details/123497939)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":...

CentOS安装BiocManager

09-11

您可以通过BiocManager的`install()`函数来安装特定的Bioconductor包，或者使用`BiocManager::install()`来更新所有需要的包。 ```R BiocManager::install() ``` 4. 如果您只需要安装特定的Bioconductor包，例如`...

biocmanager包安装

最新发布

09-17

biocmanager是一个R语言的包，主要用于管理和更新Bioconductor库中的软件组件。Bioconductor是生物信息学领域的一个R软件项目，提供了一系列用于高通量数据处理、分析和可视化的工具。安装`biocmanager`的步骤如下...

biocmanager安装r包

09-16

BiocManager还提供其他一些有用的函数，如`update()`函数用于更新已安装的包，`valid()`函数用于检查包是否存在，并且提供了一些其他管理Bioconductor软件包的函数。通过BiocManager可以轻松地安装和管理...

安装biocmanager的详细教程

09-13

安装`biocmanager`是一个用于管理和更新R语言生物信息学软件包的工具。以下是通过R语言CRAN（Comprehensive R Archive Network）官方仓库安装`biocmanager`的一般步骤： 1. **确保已经安装了R和RStudio**（如果尚未...

R语言安装包报错：package ‘EDASeq ’ is not available for Bioconductor version ‘3.15‘

Shermin_96的博客

11-13

6084

package ‘EDASeq ’ is not available for Bioconductor version '3.15'

BiocManager的安装、更新 r包更新

生信小博士的博客

02-16

3770

BiocManager::install("需要更新的包的名字", update = TRUE, ask = FALSE)#版本不符合当前R包，可以根据提示更新到与R相应的版本，例如，#先选择镜像，这里是清华镜像，然后安装。#，然后根据提示更新需要更新的包。#查看是否有需要更新的包。

安装Bioconductor包和加载DESeq2包的报错问题解决

weixin_41796972的博客

10-28

1万+

旧方法（现在不能用） #错误1: Error in file(filename, “r”, encoding = encoding) : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(filename, “r”, encoding = encoding) : InternetOpenUrl failed: ‘操作超时’。 #解决1: 换镜像/网速问题。 #错误2: With R version 3.5 or greater.

Biomanager设置国内镜像

qq_45759229的博客

09-16

2837

有的时候，使用Biomanager下载包时，会出现下载很慢的问题，这个时候需要修改源 options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")