BiocManager还是很香的,只需要BiocManager::install("XXXX")一键安装
但有米有宝宝发现它的更新也很烦,不更新吧,包装不上,更新吧,很多包更新失败不仅安装不上,连以前的包也不能用了;
SO,,,,不敢随便更新包的节奏
那就只能用conda了,目前很多bioconda的R包安装还是很方便的。
普适性命令:
conda install -c bioconda bioconductor-XXX
## XXX可以直接输入R包的名字
有个问题就是,有些包的大小写在bioconductor里头和实际应用并不同,如何查询名字:
贴出网址:
可以自行ctrl+F检索,很多包,甚至冷门包都有,还是双手推荐的。