R包安装问题合集

warning引发的bug

如果R包安装没有提示error，却又安装失败了，那就需要审视一下是不是有其他提示信息了：
例如:

其实说的很清楚，需要下载Rtools，但给出的地址是官网地址，下载速度很慢，我们可以用镜像代替：
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/Rtools/
100多兆，飞一般的速度！

windows 升级R

使用installr::updateR（）命令更新R。更新后，它会将所有已安装的软件包移动到新R的库文件夹中，并将其更新为最新版本，完全无痛！

if(!require(installer)) install.packages("installr")
installer::updateR()

一条命令升级所有R包

if(!require(rvcheck)) install.packages("rvcheck")
rvcheck::update_all()

这个问题是因为我的两个R包安装路径出现了冲突，我把前面几个以逗号分隔的单词复制到必应搜索：

发现他们都指向同一个包：lattice，有印象这是基础包里的用作作图的包，不过我好像没用过。删除一个路径中的这个包对应的文件夹，就解决了。

升级3.6后安装Bioconductor 包报错

Error: Bioconductor version '3.8' requires R version '3.5'; see https://bioconductor.org/install

Bioconductor 的包都升级就好了

BiocManager::install(version = "3.9")

参考链接：https://www.jianshu.com/p/598b4c58dead