NGS基础 - 高通量测序原理

最新推荐文章于 2024-01-12 14:34:11 发布
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原文链接：http://www.cnblogs.com/wangprince2017/p/9818071.html
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NGS基础 - 高通量测序原理

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。

 

NGS基础系列文章包括高通量测序原理，测序数据获取和质量评估，常见文件格式解释和转换4部分。

 

本文 (高通量测序原理) 涉及测序文库构建原理、连特异性文库的构建方式和识别方法、测序簇生成过程、双端测序过程、测序接头产生、PCR duplicate、测序通量选择标准等。

 

转载于:https://www.cnblogs.com/wangprince2017/p/9818071.html

weixin_30748995
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NGS测序原理
weixin_69556916的博客
05-04 1225
Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题，它的主要测序错误来源是碱基的替换，目前它的测序错误率在1%-1.5%之间，测序周期以人类基因组重测序为例，30x测序深度大约为1周。经过不断的扩增和变性循环，最终每个DNA片段都将在各自的位置上集中成束，每一个束都含有单个DNA模板的很多分拷贝，进行这一过程的目的在于实现将碱基的信号强度放大，以达到测序所需的信号要求。这两个系列的机器采用的都是边合成边测序的方法，它的测序过程主要分为以下4步。
生信小白学习日记Day2——NGS基础 illumina高通量测序原理
weixin_42953727的博客
05-26 1万+
2019年5月26日，周日，小雨 说明：阅读生信宝典和查阅文章的总结，原文请关注公众号生信宝典，参考的博文都附有链接，仅供参考。 生信宝典 NGS基础——高通量测序原理 本文介绍了测序文库构建原理、链特异性文库构建方式和识别方法、测序簇生成过程、双端测序过程、测序接头产生、PCR duplicate、测序通量选择标准等。原文都是一张张PPT，截图下来之后，附一些自己理解的注释吧 以目前最常用的il...
NGS系列文章 - 高通量测序原理
悟道西方
12-09 1167
NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述...
高通量测序是什么技术，通俗易懂点
Hangzhou_Guhe的博客
01-12 1317
DNA 测序是测量各种生命形式主要特性的基础。自20世纪50年代发现DNA双螺旋结构后，全世界科学家们就开始致力于确定不同物种基因组的原始序列。这一任务被称为基因组测序，旨在揭示不同生物的基因组组成和基因的排列顺序。 现代基因组研究标志之一是生成大量原始序列数据。这项工作的重要性在于，基因组序列的破译可以提供关于生物的遗传信息，包括基因功能、遗传变异和进化关系等方面重要线索。 在过去的几十年里，随着测序技术的不断发展和突破，测序的速度和精度都得到了显著提高。早期的测序方法主要依赖于Sanger测序技术，
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析
wangprince2017
03-15 5535
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析 2020.9.01 2060 　　随着人类基因组计划（human genome project ）在2003年顺利完成，基因组测序技术取得了长足的进步，这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊，这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以获得更多的数据量。与之对应的是，还有一些技术的进步使得单条序列的测序读长变得更长——这对解析结构性的复合区段是极其必要的。这些
基因-高通量测序-变异检测
C橘子
11-09 2933
基因变异检测 ​ 本周的任务是弄清楚基因检测是什么，本来以为挺简单的，后来发现自己基本的染色体都忘干净了。 ​ 基因变异检测看名字就知道是针对基因的，但是基因是什么呢？感觉基因像是一种抽象的概念，那么该怎么检测呢？ 1. 什么是基因 ​ 基因（英语：gene），在生物学中是指“携带遗传信息的基本物质单位”（基本遗传单位）。而自从确定遗传信息的分子载体为核酸后，基因即指能够遗传且具功能性的一段DNA或RNA序列，详细来说，其为DNA或RNA大分子内一段编码基因产物（RNA或蛋白质）的合成)的核苷酸序列。
高通量测序原理.pptx
12-26
高通量测序，也称为下一代测序(NGS)，是一种现代生物技术，它极大地提升了DNA测序的速度和规模，从而使得大规模基因组研究成为可能。在这个领域中，Illumina公司的Solexa技术是尤为重要的一个里程碑。下面将详细阐述...
生物信息学软件_高通量测序技术|生信的发展，常用数据格式及分析软件
weixin_39819152的博客
12-03 1760
WeDiscover发起基因检测技术经典书籍共读活动，第一季共读李金明教授的《高通量测序技术》，今天解读第四章前两节关于生物信息学的发展，常用数据存储格式及分析软件。随着高通量测序技术的快速发展，其已由实验室研究逐步应用于临床。高通量测序检测对临床患者的诊断、治疗及预后判断具有重要的指导意义。高通量测序检测流程可分为实验室操作(称为湿实验)和生物信息学分析(称为干实验)。高通量测序技术离...
2019-应用二代测序技术进行胚胎植入前遗传学筛查及诊断的基本原理.pdf
08-16
NGS是一种高通量的测序技术，其核心策略是鸟枪法，即随机打断DNA分子，然后对碎片进行测序。这种方法能够同时处理大量的样本，大大提高了效率。NGS的优势在于其广泛的应用范围，可以检测多种遗传变异，包括单核苷酸...
NGS概念科普
vickyleexy's blog
06-29 1万+
转载于：http://qcbio.biomart.cn/news/2845387.htm 近年来NGS飞速发展，各大测序平台百花齐放，现小翊整理了一些NGS相关基础概念，供同学们查看。 测序基础概念 NGS（下一代测序技术）：又称高通量测序，以高输出量和高解析度为主要特色，能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列读取，在提供丰富的遗传学信息的同时，还可大大降低测序费用、缩短测序时间...
NGS各种组学建库原理（图解）
qq_21478261的博客
08-08 4446
本文分享llumina官网上的各种组学建库原理图，分三个方向：Seq—DNA（DNA层面）、Seq—RNA（RNA层面）、Seq—Single-Cell（单细胞层面）。
《生物信息学：导论与方法》----新一代测序NGS：重测序的回帖和变异鉴定----听课笔记（九）
wxw060709的专栏
09-15 637
第五章新一代测序NGS 5.4 关于回帖、变异鉴定的补充材料 BWT算法是BWA软件所使用的压缩算法，它可以对数据进行无损压缩，它对字符串乱转后得到的字符矩阵进行排序和变换，使数据更容易被压缩。 BWT算法利用逆字符的方法去检验是否存在相同（匹配）的区域，它不能处理gap。 L列和F列的两个性质： L列的序列是其所对应的F列的序列在原始序列中的前一位。 L列中字母出现的顺序和F中的相...
NGS测序二三事
weixin_43865392的博客
11-29 3616
NGS测序的二三事常见误区一些计算duplication reads 常见误区 在测序时，我们需要将DNA打断成fragment，构建library。这些fragment需要接上adaptor再扩增。illumina测序分为两种：single end 和 paired end。insertion 不是指R1 和 R2之间的unknown gap，而是adaptor间的序列。 而unknown ga...
二代测序原理及其流程
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Christina
06-19 2万+
第二代测序（Next-generation sequencing，NGS）又称为高通量测序，其开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序，在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱基所携带的特殊标记来确定DNA序列。 二代测序有两个重要特点：1．高通量，二代测序能一次并行对几十、几百万条DNA分子进行测序；2．读长短，测序过程随着读长增长，基因簇复制的协同性降低，会导致测序质量下降，二代测序的读长不超过500bp。因此基因组、宏基因组需要被打断成小片段再测序，测序完毕后再拼接。下面以Illumina测序法
NGS测序基础梳理01-文库构建（Library Preparation）
qq_21478261的博客
04-28 9080
本文介绍Illumina测序平台文库构建步骤，文库结构。
三代基因组测序技术原理简介
weixin_30484739的博客
08-02 5237
考虑到cnblog不适合基因组领域这种类型的文章， 最终，我自己开通了公众号：碱基矿工，欢迎感兴趣的同学关注！ 也可以关注我的知乎：https://www.zhihu.com/people/yellowtree/activities 2018年1月修改：这篇文章写于2013年，首发在cnblog上，目前已经比较旧了。我重新在WGS系列中对其进行重写，建议移步到这里 　...
NGS测序基础梳理03-图解边合成边测序（Sequencing by Synthesis）
qq_21478261的博客
04-30 3418
介绍Illumina平台边合成边测序（Sequencing by Synthesis，SBS）原理、过程，数据拆分。
NGS基础：测序原始数据下载
悟道西方
07-12 5923
生物或医学中涉及高通量测序的论文，一般会将原始测序数据上传到公开的数据库，上传方式见测序文章数据上传找哪里；并在文章末尾标明数据存储位置和登录号,如 The data from this study was deposited in NCBI Sequence Read Archive under accession SRA: SRP114962.。 NCBI的SRA (Sequence Rea...
低通量测序和高通量测序的区别
最新发布
06-27
低通量测序（Sanger sequencing）和高通量测序（Next-Generation Sequencing，NGS）是两种截然不同的基因测序技术。 1. **低通量测序**： - 这种方法是早期广泛使用的测序技术，也称为第二代测序或定序法。 - 它...
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