ggplot绘制柱状图 python_ggplot2|绘制GO富集柱形图

生信分析中经常会得到一些基因，然后做GO富集分析，达到对基因进行注释和分类的目的。

本文利用R语言的ggplot2包，从头带您绘制可发表级别的GO富集分析结果图。

一 载入数据集和R包

利用各种生信工具得到富集分析结果，数据列可能不一致，但关键几列都有。

library(ggplot2)data

二 对上述GO结果绘制基础bar图

参照之前ggplot2使用方法，更改geom即可绘制简单的bar图，按照GO_category分组颜色

ggplot(data=data, aes(x=GO_term,y=Num_of_symbols_in_list_in_GO, fill=GO_category)) + geom_bar(stat="identity", width=0.8)

可看出和文献中的差距较大，体现在以下几个方面：

A：标题，坐标轴“业余”；

B：GO_category顺序未按照输入文件，相同GO_category没在一起；

C：横坐标label太长，重叠在一起。

三  “细节”调整GO结果bar图

3.1 坐标轴调整策略

#将GO_term设定为factor即可按照顺序输出GO_term_order=factor(as.integer(rownames(data)),labels=data$GO_term)ggplot(data=da