fasta文件中序列的排序

本文介绍如何处理名为read_1.fa的fasta文件,该文件包含多个序列。通过示例代码展示了如何对这些序列进行排序,代码来源于网络分享。
摘要由CSDN通过智能技术生成

同样的名为read_1.fa 的fasta文件,里面有若干序列,如:

>@r1
TGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACNGTACGCTGAGGGCAGAAAAAATCGTCGGGGACATTNTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCG
>@r2
NTTNTGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGATCACCCTGTGGGTTTAT
>@r3
ATCGCCCGCAGACACCTTCACGCTGGACTGTTTCGGCTTTTACAGCGTCGCTTCATAATCCTTTTTCGCCGCCGCCATCAGCGTGTTGTAATCCGCCTGCAGGATTTTCCCGTCTTTCNGTGCCTTGNT
..........等等

 

直接看代码:

 1 #encoding = utf-8
 2 
 3 """
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