[笔记]python对FASTA文件的处理

这学期选了生信的选修课—perl/python在生物信息学中的应用

把结课作业的代码整理出来主要是python对FASTA文件的读取和数据处理

FASTA文件数据处理

FASTA文件读取：

只含一个基因序列

将FASTA文件的基因序列读取到一个列表中，列表中的每个元素为每一行基因序列构成的字符串

f=open('/home/miaoyr/perl_practice/test1_file/DTNBP1.fasta')
ls=[]
for line in f:
        if not line.startswith('>'):    
                ls.append(line.replace('\n','&#