lammps建模_Lammps模型构建的方法之一：组合模型构建

最新推荐文章于 2024-07-07 23:44:50 发布

黑科技玩机

最新推荐文章于 2024-07-07 23:44:50 发布

阅读量3k

点赞数 5

文章标签： lammps建模

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_33746833/article/details/112310169

版权

本文介绍了如何在Lammps中构建组合模型，特别是将通过Material Studio (MS) 建立的12烷聚合物模型与在Lammps内直接构建的Al金属模型相结合。在MS中使用pcff力场建模，通过msi2lmp转换为data文件。Lammps中通过规范的in文件读取两个模型并进行组合，设置混合势以描述不同部分间的作用。这种方法将建模与计算分离，便于后续仿真。文章还提及了建模过程中的注意事项和力场限制。

摘要由CSDN通过智能技术生成

对于Lammps初学者，建模的方法主要有以下几种：1、在Lammps中自行建模，适合金属等简单的模型，如果遇到聚合物就比较麻烦了；2、通过第三方软件建模，例如：Matlab、Python、VMD、Material Studio(MS)等软件，建完模型转换成data文件导入到Lammps中。今天本文主要是介绍在MS中建聚合物，以12烷为例，导入到Lammps中，再在Lammps中建立金属模型，以Al为例，再组合生成一个完整模型，以便于后面开展计算，同时在建模的过程中解释很多新手在学习这种组合模型构建的困惑。

首先介绍在MS中建聚合物12烷，具体建模方式可以学习手册，这里说12烷在进行创建盒子和进行几何优化都使用pcff力场，如图1，然后生成*.car文件，使用Lammps自带的msi2lmp进行文件转换，生成data文件。MS的模型有很多种方法转换到适合Lammps的data文件，本文只针对msi2lmp转换这种方式进行描述。在这里面需要解释为什么在MS里建聚合物，而不在这里建金属模型。MS有个巨大的问题是在于这里面的力场和msi2lmp进行转换的时候只有两种力场可以互相转换：cvff和pcff力场，如图2。而cvff和pcff力场都是适用于有机物，如图3，所以金属模型在这里转换的时候需要把键都要删除，否则类似氧化铝这种金属之间有Al-O键，在cvff和pcff力场中是无法识别的，所以要是建复杂一点的金属模型就很麻烦，但是单晶的金属在这里建都无妨。所以本文最终选择只在MS中建立12烷，使用pcff力场。