植物 miRNA 研究

相比动物miRNA 而言， 植物miRNA 的研究相对较少。

植物miRNA 相比动物miRNA , 有以下特点：

1） 植物miRNA 的长度为 21 nt 左右， 动物miRNA 长度在 22 ~ 23 nt;

2)   植物 miRNA 与 靶标转录本几乎完全互补配对，而动物 miRNA 不是；

3） 植物 miRNA 结合的区域可以位于任何区域，而动物 miRNA 主要在3‘ UTR 区结合；

植物miRNA 的形成过程：

 

pri-miRNA          =>               pre-miRNA   =>  mature miRNA 

植物miRNA 的作用机制：

1） 与靶标完全互补配对：  降解mRNA

2)   与靶标不完全互补配位： 抑制翻译 

植物miRNA 预测软件：

 1)  miRPlant : https://sourceforge.net/projects/mirplant/

2)  miRDeep-P

植物miRNA 靶标预测软件：

1）  psRNATarget :    http://plantgrn.noble.org/psRNATarget/

2)  miRU :

植物miRNA 相关数据库

PMTED : http://pmted.agrinome.org/tutorial.jsp#species

 

植物miRNA 靶标预测软件：

参考资料:

　　　　Plant microRNA: A small regulatory molecule with big impact