New Phytol | 植物miRNA-转录因子-靶基因模块调控网络如何构建

microRNA被认为是在转录后水平调控基因表达的关键调节因子，已被发现参与了植物的生物过程。比如在植物发育、应激响应和二次代谢过程中，发现了一些微小RNA上调或下调。

过去几年，多篇报道已经证明miR160与各种物种中不同组织和器官发育直接相关，以及植物与环境相互作用。miR160-ARF模块对植物重要性状的贡献较多，而且由于其普遍存在的特质以及多样的改良可能性，使其成为作物育种的备受期待的遗传操作靶点，因此不少研究以“miR160-ARF”模块为研究的切入点。

近几年“miR160-ARF模块”相关研究文章

图：miR160-ARF模块在植物中的作用。(A) miR160-ARF在不同植物生长发育过程中的作用列表。(B) miR160参与的植物胁迫响应摘要。蓝色表示基因下调;红色代表基因上调。[1]

本期，我们带来了一篇来自山东农业大学和广州大学研究团队发表在New Phytologist题为“A novel miR160a-GmARF16-GmMYC2 module determines soybean salt tolerance and adaptation”的研究论文。该研究鉴定了一个miR160a-GmARF16-GmMYC2模块，并研究其在大豆盐胁迫反应中的调控。通过这篇文章，我们来看看miRNA-转录因子-靶基因模块的调控网络研究思路有哪些值得参考的。

• 中文标题：一个新的miR160a-GmARF16-GmMYC2模块决定了大豆的耐盐性和适应能力

• 期    刊：New Phytologist

• 影响因子：9.4

• 发表时间：2024年5月

• 研究单位：山东农业大学和广州大学

研究背景

盐胁迫是对大豆生长和产量产生负面影响的主要挑战。因此，了解盐响应的调控机制对保证这种条件下的大豆产量具有重要意义。miR160-ARF模块是提高作物抗逆性的潜在工程靶点。然而，还需要进一步的机制理解来充分阐明该模块参与非生物应激反应的分子细节。研究团队之前通过利用盐响应转录组数据重新分析盐胁迫8小时下miRNA前体序列的表达，发现miR160家族成员在大豆中表现出对盐胁迫的反应。然而，miR160及其靶基因在盐胁迫响应中的确切作用值得进一步研究。

技术路线

研究结果

1. 大豆miR160a作为响应盐胁迫的正调控因子

MicroRNAs（miRNAs）在植物发育和响应环境胁迫中发挥作用，并可通过引起mRNA降解和翻译抑制来诱导基因沉默。MiR160是一种已知的miRNA，通过靶向生长素反应因子（ARFs&