sRNAanno
优点
【1】miRNA注释中使用了一致且高度严格的标准,因此它们更加完整和可靠
【2】提供了免费访问来自这143个植物物种的> 22,721个PHAS基因座和> 2,200万个hc-siRNA基因座的基因组信息
【3】向社区提供了sRNA注释的免费服务
【4】注释包括三类:miRNAs、phasiRNAs和hc-siRNAs
功能
【1】 BROWSE, 用于浏览注释结果
【2】 SEARCH, 用于搜索某些信息
【3】 RESOURCES,用于数据分享
在“BROWSE”页面上,用户可以从大型系统发育树中选择一个或多个物种,然后浏览或下载相应的小RNA注释结果(图1B)
SEARCH功能包括通过miRNA名称或使用BLAST功能进行序列比较进行miRNA搜索(图1C)
RESOURCES页面可快速访问Small RNA Annotation Service页面和其他相关数据(图1D)
下载专为sRNA数据浏览而设计的免费软件IGV-sRNA
原文
sRNAanno—a database repository of uniformly annotated small RNAs in plants