go kegg_对miRNA进行go和kegg等功能数据库数据库注释

如果大家对go和kegg等功能数据库注释有一定了解，就应该是知道kegg其实里面就记录各个物种不到一半的蛋白编码基因功能，比如人类， 约2万个蛋白编码基因，也就七千多个是有kegg功能注释的。其它物种就更是惨不忍睹，没有那么多科研经费投入进去，实际上对它们的基因功能就无从得知！

不过，哪怕是对人类来说，kegg注释的也仅仅是蛋白编码基因，但是如果你了解人类gtf文件，就应该是知道，里面有6万左右的基因，如果我们的差异分析，定位到了 lncRNA，假基因，miRNA的基因，其实就不能直接进行功能数据库注释。我们以miRNA为例， 每个miRNA都是可以靶向调控数百甚至数千个蛋白编码基因，所以我们如果要对miRNA进行go和kegg等功能数据库数据库注释，就需要以靶向调控为桥梁。前面我们介绍了两次关于miRNA的靶向基因的查询工具，分别是：

• microRNAs靶基因数据库哪家强
• 使用miRNAtap数据源提取miRNA的预测靶基因结果

而且我们也多次讲解了go和kegg等功能数据库数据库注释，见：

• 从基因名到GO注释一步到位
• 3大在线分析工具:Enrichr、WebGestalt、gprofiler与R包clusterprofiler的比较

所以，理论上你能够查询到miRNA的靶向基因，就可以用靶基因作为桥梁去进行数据库注释啦！当然，如果你不想看这个中间过程&#