miRPath:miRNA相关GO和KEGG功能分析

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对于mRNA数据,我们经常通过GO和KEGG富集分析来进行功能分析,对于miRNA数据而言,我们可以通过miRNA对应的mRNA来研究miRNA相关功能。
miRpath是一个在线网站,集成了miRNA靶基因数据库, 只需要输入感兴趣的miRNA Id, 就可以从靶基因数据库中获取miRNA对应的靶基因,然后进行GO和KEGG富集分析,网址如下

http://www.microrna.gr/miRPathv3/

该数据库中集成以下3个miRNA靶基因数据库

  1. TarBase

  2. TargetScan

  3. microT-CDS

支持以下几个物种的GO和KEGG富集分析

  1. Human

  2. Mouse

  3. D.melanogaster

  4. C.elegans

  5. R.Norvegicus

  6. D.Rerio

  7. G.Gallus

该数据库有以下两种使用方式

1. 正向检索

正向检索功能用于分析指定miRNA的功能,输入框如下所示

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