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对于mRNA数据,我们经常通过GO和KEGG富集分析来进行功能分析,对于miRNA数据而言,我们可以通过miRNA对应的mRNA来研究miRNA相关功能。
miRpath是一个在线网站,集成了miRNA靶基因数据库, 只需要输入感兴趣的miRNA Id, 就可以从靶基因数据库中获取miRNA对应的靶基因,然后进行GO和KEGG富集分析,网址如下
http://www.microrna.gr/miRPathv3/
该数据库中集成以下3个miRNA靶基因数据库
TarBase
TargetScan
microT-CDS
支持以下几个物种的GO和KEGG富集分析
Human
Mouse
D.melanogaster
C.elegans
R.Norvegicus
D.Rerio
G.Gallus
该数据库有以下两种使用方式
1. 正向检索
正向检索功能用于分析指定miRNA的功能,输入框如下所示