今天的主要内容是实现下面这幅图
做完聚类分析通常可以选择 树形图来展示聚类分析的结果,之前公众号也分享过一篇文章 。如果样本数不是很多,可以选择矩形的树状图。但是样本数如果比较多,比如今天一位公众号的读者留言说他有160多个样本,这样 矩形的树状图就会比较宽或者比较长。这个时候就可以选择用 圆形的柱形图来展示。
那么圆形的树状图如何实现呢?我查找了一下相关资料。 R语言包dendextend
这个包可以实现,利用help(package="dendextend")
查看帮助文档,能够看到其中的一个小例子
iris2<-iris[,-5]
species_labels<-iris[,5]
library(colorspace)
species_col<-rev(rainbow_hcl(3))[as.numeric(species_labels)]
d_iris<-dist(iris2)
hc_iris<-hclust(d_iris,method="complete")
iris_species<-rev(levels(iris[,5]))
iris_species
library(dendextend)
dend<-as.dendrogram(hc_iris)
dend <-