壮观霉素抗性基因原理_全基因组水平研究染色质可及性的方法

伯豪生物出品

染色体上开放区域与对应转录因子或其他调控蛋白的结合直接影响细胞内基因复制和转录行为的发生。精确地在基因组上鉴定这些特定开放的DNA区域对于发掘基因组调控元件至关重要。失去了核小体保护的DNA序列,相比于缠绕在核小体上的DNA序列具有更高的活性，更容易被核酸酶、转座酶或物理化学手段切割或打断，形成长短不一的DNA片段。因此，目前研究染色质可及性主要通过酶解或者超声处理的方法对开放区域的DNA进行片段化处理。目前研究染色质可及性的方法主要有以下四种：MNase-seq、DNase-seq、FAIRE-seq和ATAC-seq，其中MNase-seq是通过对核小体保护的DNA测序，从而间接反映染色质可及性的方法，其他三种均为对检测染色质上的开放区域，直接反应染色质的可及性。

ChIP-seq、MNase-seq、DNase-seq、FAIRE-seq和ATAC-seq技术概览

MNase-seq微球菌核酸酶（Micrococal nuclease, MNase）是来源于金黄色葡萄球菌分泌的一种核酸酶，同