imagej得到灰度图数据_北大博士教你如何从图像中获得可用的灰度数据

原标题:北大博士教你如何从图像中获得可用的灰度数据

如何从图像中获得可用数据系列,出到第三期啦。

前两期说的是如何从图像中获得数字(

)和大小(),把一些主观图片转化成客观、投稿可用的数据。今天我们讲的是另一个非常重要的内容:如何在图像中测灰度。

灰度是一个非常重要的量度,是在 WB 条带等有颜色的图像中都可以测出的数据,闲话不说,我们来看看图文视频示例吧……

实例操作:共聚焦图片的灰度

比较下边两张共聚焦图片中细胞的绿通道平均灰度值,绘制柱形图。

适用软件

Image-Pro Plus 6.0

主要菜单命令

Measure→Calibration→Intensity【校正标尺】

Measure→Count/Size【圈对象,求灰度】

灰度只是半定量。

灰度并不等同于浓度。

两者有相关性,但不是线性关系。

Measure→Calibration→Intensity 应该采用何种校正方式?

Free Form

背景呈黑色或深色

待测物质呈亮色或浅色

推荐观测指标:Density 等

Std. Optical Density

背景呈白色或浅色

待测物质呈深色或黑色

推荐观测指标:IOD

图像求灰度的其他应用

电泳条带的半定量

ImageJ,ImageLab,QuantityOne,

Bandscan 等软件都可实现条带分析

免疫组化染色的半定量

视频手把手示范操作

文章作者:北京大学博士张浩然,经其授权转载。

图片来源:张浩然、网络

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