原标题:北大博士教你如何从图像中获得可用的灰度数据
如何从图像中获得可用数据系列,出到第三期啦。
前两期说的是如何从图像中获得数字(
)和大小(),把一些主观图片转化成客观、投稿可用的数据。今天我们讲的是另一个非常重要的内容:如何在图像中测灰度。
灰度是一个非常重要的量度,是在 WB 条带等有颜色的图像中都可以测出的数据,闲话不说,我们来看看图文视频示例吧……
实例操作:共聚焦图片的灰度
比较下边两张共聚焦图片中细胞的绿通道平均灰度值,绘制柱形图。
适用软件
Image-Pro Plus 6.0
主要菜单命令
Measure→Calibration→Intensity【校正标尺】
Measure→Count/Size【圈对象,求灰度】
灰度只是半定量。
灰度并不等同于浓度。
两者有相关性,但不是线性关系。
Measure→Calibration→Intensity 应该采用何种校正方式?
Free Form
背景呈黑色或深色
待测物质呈亮色或浅色
推荐观测指标:Density 等
Std. Optical Density
背景呈白色或浅色
待测物质呈深色或黑色
推荐观测指标:IOD
图像求灰度的其他应用
电泳条带的半定量
ImageJ,ImageLab,QuantityOne,
Bandscan 等软件都可实现条带分析
免疫组化染色的半定量
视频手把手示范操作
文章作者:北京大学博士张浩然,经其授权转载。
图片来源:张浩然、网络
一大波公开课来袭,有分子生物学,有论文投稿等等,请加颜值担当菌菌,微信号: biotalk。点击下方阅读原文查看更多。
责任编辑: