gromacs 安装_gromacs cpu版安装

安装准备cmake2.8.8 or later

C,C++

3.gromacs包

http://www.gromacs.org/Downloads

安装步骤tar xfz gromacs.tar.gz

cd gromacs

mkdir build

cmake ../

-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/software/gromacs 指定安装目录

-DGMX_BINARY_SUFFIX=_5.0.7_s  指定执行文件后缀 默认为gmx(串行单精度)，gmx_mpi(并行单精度)，gmx_mpi_d(并行双精度)

-DGMX_LIBS_SUFFIX=_5.0.7_s       库文件后缀

-DGMX_MPI=ON                             使用mpich编译器build

-DGMX_OPENMP=ON                   使用openmpi编译器build

-DGMX_SIMD=None                        specify the level of SIMD support of the node on

which mdrun will run

-DGMX_X11=ON

-DGMX_DEFAULT_SUFFIX=OFF        关掉默认后缀

-DCMAKE_CXX_COMPILER=icpc      指定C++编译器

-DCMAKE_C_COMPILER=icc            指定C编译器

-DBUILD_SHARED_LIBS=ON             构建共享库

-DGMX_BUI