生信R语言基础【1】

R语言500行。

别看这是一个小文档，整个数据挖掘都以他作为基础

欲练此功，必先学习

什么叫注释,只需要一个#

###############################################

1.R语言基础

基本计算，加减乘除 +，-，*，/,>, <, == ,!=, >=,<=

3+3

100-7

4*5

22/7

355/113

3^2

log2(16)

###############################################

产生逻辑的最主要方式是比较

只能是两种TRUE，FALSE，使用时可简写为T和F

2 > 5

5 >= 3

6 < 7

2 <= 5

5 != 6

5 == 6

###############################################

数据的基本类型

常用函数class()

查看数据的属性,函数的调用是用的小括号

class(2)

class("china")

class(TRUE)

class(T)

class(FALSE)

class(F)

class(mtcars)

class(as.matrix(mtcars))

###############################################

2.数据结构

2.1向量

c(),rep(),seq()

c就是combine,合并多个元素来创建向量

rep就是replicate,重复元素，

seq就是sequence,产生序列

注意,函数的参数之间需要逗号分隔

c(1,3,6)

c("TP53","ERBB2","BRCA1")

rep(1,3)

rep("A",3)

常用操作

rep(c("control","treat"),3)

rep(c("control","treat"),each=3)

如何知道rep的功能,？

seq的几种用法

seq(1,3)

seq(5,10)

seq(5,10,2)

seq(1001,20000)

你能口算结果么？

c(rep(1,3),seq(2,5))

###############################################

2.2变量

cancergene <- c("TP53","ERBB2","BRCA1")

b <- c("zhangsan","lisi","wangermazi")

获取元素

想一下获取元素的符号[],跟小括号区别开()

b[1]

b[2]

b[2:3]

获取到的元素也可以成为新的变量

mydata <- b[2:3]

向量的长度，length

length(b)

length(mydata)

向量的命名

names(b) <- c("A","B","hello")b

###############################################

产生随机数

sample(seq(1,100), 9)

sample(seq(1,100), 9)

set.seed, 设定随机种子固定随机数，分析中用不到，教学用

如何理解set.seed

set.seed(811)

sample(seq(1,100), 9)

把产生的随机数赋值给变量myNumber

set.seed(811)

myNumber <- sample(seq(1,100), 9)

myNumber

R语言中认识的单词都是函数

max(myNumber)

min(myNumber)

sum(myNumber)

mean(myNumber)

###############################################

复习：看函数名称反应出功能

class(),

c(),

rep(),

seq(),

length(),

names(),

sample()

max()

min()

sum()

mean()