r语言upsetview模拟数据_R语言学习 - 韦恩图

韦恩图

韦恩图是用来反映不同集合之间的交集和并集情况的展示图。一般用于展示2-5个集合之间的交并关系。集合数目更多时，将会比较难分辨，更多集合的展示方式一般使用upSetView。

较早的文章列举了多个在线工具轻松绘制各种Venn图。这篇文章讲解下如何用R代码一步出图。

韦恩图一步法

假设有这么一个矩阵，第一列为不同集合中的ID，第二列为集合的名字，无标题行，存储为venn.txt。

a    ehbio1b    ehbio1c    ehbio1d    ehbio1e    ehbio1f    ehbio1g    ehbio1h    ehbio2i    ehbio2j    ehbio2k    ehbio2e    ehbio2f    ehbio2g    ehbio2a    ehbio3b    ehbio3h    ehbio3j    ehbio3i    ehbio3f    ehbio3g    ehbio3a    ehbio4b    ehbio4h    ehbio4d    ehbio5e    ehbio5y    ehbio5x    ehbio5选取所有的5个集合，绘制韦恩图

# -f: 指定输入文件的名字，格式如上

# -a: 指定第一个集合的名字 (-f指定的文件中第二列的某个字符串)

# -b: 指定第二个集合的名字 (-f指定的文件中第二列的某个字符串)

# -c, -d, -g: 指定第三、四、五个集合的名字

sp_vennDiagram.sh -f venn.txt -a ehbio1 -b ehbio2 -c ehbio3 -d ehbio4 -g ehbio5

选取其中4个集合，绘制韦恩图

# -f: 指定输入文件的名字࿰