OVIS数据集代码解析

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分类专栏： Tools 文章标签： python 数据集 OVIS

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OVIS数据集代码解析

OVIS数据集格式整体和COCO类似，但是是以video的形式存储的，对应的解析代码见：https://github.com/qjy981010/cocoapi/blob/main/PythonAPI/pycocotools/ovis.py。

由于OVIS仅train提供了标注，因此，这里均以train进行说明。

1.init函数

创建一些字典，包括dataset、anns、cats、vids以及vidToAnns、catToVids。

其中dataset是原始标注数据，由json文件读取得到。
这里对其进行详细说明

dataset包括5个key：

info: 主要是存储一些meta信息，如下：

‘description’: ‘OVIS’,
‘url’: ‘http://songbai.site/ovis/’,
‘version’: ‘1.0’,
‘year’: 2021,
‘contributor’: ‘youku’,
‘date_created’: ‘2021-01-01’

licenses: 存储licenses信息。
categories: 类别信息。OVIS一共包括25个类别，每个类别包括三个信息：supercategory表示该类别的超类，OVIS都设置为object，id表示该类别的id，而name则是该类别的字符串名称。

具体类别及对应实例数目如下：

可以看出，person是主要类别。
videos: 视频详细信息。训练集一共包含607段视频，每段视频的信息以一个字典构成，因此，videos是一个长为607的列表。

每个视频信息字典包含6个基本属性：
- width: 视频的宽
- height: 视频的长
- license: license id
- file_names: 对应图片的相对路径，例如’85aa3b0e/img_0000001.jpg’，说明该图片位于85aa3b0e视频文件夹下，图片名称为img_0000001.jpg
- id: 视频id
- length: 该视频采样得到的图片数目
annotations: 该视频中所有标注实例的信息。这里和coco存在一定差异。由于OVIS是一个视频数据集，这里的实例是针对视频进行描述的。例如一个视频假设有500帧，某一个人物在这个视频中出现了，那么该人物就是一个实例，其在该视频中500帧图片中的实例id都是一致的。这里的标注就是采用以上设置给出的。

每个实例标注由一个字典表示。每个字典有11个基本属性：
- length: 数值全为1，不太清楚具体含义
- category_id: 该实例的类别id
- video_id: 该实例对应所在的视频id
- iscrowd: 这里的iscrowd应该和coco不太一样，不用于区分segmentation的类别。（在coco中，iscrowd=0时意味着segmentation的格式为polygon，iscrowd=1时则意味着segmentation的格式为rle）
- id: 该实例对应的id
- height: 视频帧的长
- width: 视频帧的宽
- segmentations: 该实例的mask标注信息，每一帧都会给出对应的标注，如果当前帧没有该实例，则为None。这里的标注信息以字典形式给出：
  - size: 该标注对应的[height, width]，用于rle解码
  - counts: rle编码
- bboxes: 该实例的bbox标注信息，每一帧都会给出对应的标注。这里的标注以四元组 (x, y, h, w) 形式给出，其中 (x,y) 是左上角坐标。
- areas: 该实例对应的bbox的面积，每一帧都给出。
- occulusion: 该实例的遮挡情况，分为三类no occlusion, slight occlusion 以及 severe occlusion，具体说明可参考原论文。

其余字典（anns、cats、vids以及vidToAnns、catToVids）则是通过createIndex进行填充。

2. createIndex

该函数主要是用于填充在init中创建的一些属性字典。

for ann in self.dataset['annotations']:
    vidToAnns[ann['video_id']].append(ann)
    anns[ann['id']] = ann

vidToAnns: key为视频的id，而value则为一个列表，里面存储了视频id为key的所有实例信息。
anns: key为实例的id，而value即为该实例。

for vid in self.dataset['videos']:
    vids[vid['id']] = vid

vids: key为视频id，而value即为该视频信息。

for cat in self.dataset['categories']:
    cats[cat['id']] = cat

cats: key为类别id，而value即为该类别信息。

for ann in self.dataset['annotations']:
    catToVids[ann['category_id']].append(ann['video_id'])

catToVids: key是类别id，而value则为一个列表，里面存储了类别id为key的所有视频id。

3. 一些常用函数的使用

3.1 getAnnIds

def getAnnIds(self, vidIds=[], catIds=[], areaRng=[], iscrowd=None):
    """
    Get ann ids that satisfy given filter conditions. default skips that filter
    :param vidIds  (int array)     : get anns for given vids
           catIds  (int array)     : get anns for given cats
           areaRng (float array)   : get anns for given area range (e.g. [0 inf])
           iscrowd (boolean)       : get anns for given crowd label (False or True)
    :return: ids (int array)       : integer array of ann ids
    """

这个函数的作用在于在给定视频id列表、类别id列表、面积约束范围以及是否包括crowd实例的情况下，输出对应满足条件的ann id。
其大致逻辑是：

根据给定的视频id，通过vidToAnns来获取所有的实例信息。
根据类别id、面积约束范围以及是否包含crowd实例来对得到的实例信息进行筛选。
最终返回所有实例对应的id。

3.2 getCatIds

def getCatIds(self, catNms=[], supNms=[], catIds=[]):
    """
    filtering parameters. default skips that filter.
    :param catNms (str array)  : get cats for given cat names
    :param supNms (str array)  : get cats for given supercategory names
    :param catIds (int array)  : get cats for given cat ids
    :return: ids (int array)   : integer array of cat ids
    """

这个函数的作用在于在给定类别名称列表、类超类类别名称列表以及类别id列表的情况下，输出对应满足条件的类别id。

3.3 getVidIds

def getVidIds(self, vidIds=[], catIds=[]):
    '''
    Get vid ids that satisfy given filter conditions.
    :param vidIds (int array) : get vids for given ids
    :param catIds (int array) : get vids with all given cats
    :return: ids (int array)  : integer array of vid ids
    '''

这个函数的作用在于在给定视频id列表以及类别id列表的情况下，输出对应满足条件的类别id。

3.4 loadAnns, loadCats and loadVids

这些函数的作用都相近，都是根据提供对应的id列表来获取对应的信息，包括标注、类别以及视频等。

3.5 annToRLE以及annToMask

这两个函数一般使用annToMask，用于将ann转化为对应的binary mask，而annToRLE则是用于对ann进行转化。

def annToRLE(self, ann, frameId):
    """
    Convert annotation which can be polygons, uncompressed RLE to RLE.
    :return: binary mask (numpy 2D array)
    """
    t = self.vids[ann['video_id']]
    h, w = t['height'], t['width']
    segm = ann['segmentations'][frameId]
    if type(segm) == list:
        # polygon -- a single object might consist of multiple parts
        # we merge all parts into one mask rle code
        rles = maskUtils.frPyObjects(segm, h, w)
        rle = maskUtils.merge(rles)
    elif type(segm['counts']) == list:
        # uncompressed RLE
        rle = maskUtils.frPyObjects(segm, h, w)
    else:
        # rle
        rle = segm
    return rle

def annToMask(self, ann, frameId):
    """
    Convert annotation which can be polygons, uncompressed RLE, or RLE to binary mask.
    :return: binary mask (numpy 2D array)
    """
    rle = self.annToRLE(ann, frameId)
    m = maskUtils.decode(rle)
    return m

4. 解析代码

这里提供一份用于提取某个特定类别数据的代码，例如以下代码可以提取Person这个类别：

import cv2
import os.path
import numpy as np
from tqdm import tqdm

# https://github.com/qjy981010/cocoapi/blob/main/PythonAPI/pycocotools/ovis.py
from ovis import OVIS
# a tool function for parallel work
from parallel_work import parallel_work

PALETTE = [(220, 20, 60), (119, 11, 32), (0, 0, 142), (0, 0, 230), (106, 0, 228),
           (0, 60, 100), (0, 80, 100), (0, 0, 70), (0, 0, 192), (250, 170, 30),
           (100, 170, 30), (220, 220, 0), (175, 116, 175), (250, 0, 30),
           (165, 42, 42), (255, 77, 255), (0, 226, 252), (182, 182, 255),
           (0, 82, 0), (120, 166, 157), (110, 76, 0), (174, 57, 255),
           (199, 100, 0), (72, 0, 118), (255, 179, 240), (0, 125, 92),
           (209, 0, 151), (188, 208, 182), (0, 220, 176), (255, 99, 164),
           (92, 0, 73), (133, 129, 255), (78, 180, 255), (0, 228, 0),
           (174, 255, 243), (45, 89, 255), (134, 134, 103), (145, 148, 174),
           (255, 208, 186), (197, 226, 255), (171, 134, 1), (109, 63, 54),
           (207, 138, 255), (151, 0, 95), (9, 80, 61), (84, 105, 51),
           (74, 65, 105), (166, 196, 102), (208, 195, 210), (255, 109, 65),
           (0, 143, 149), (179, 0, 194), (209, 99, 106), (5, 121, 0),
           (227, 255, 205), (147, 186, 208), (153, 69, 1), (3, 95, 161),
           (163, 255, 0), (119, 0, 170), (0, 182, 199), (0, 165, 120),
           (183, 130, 88), (95, 32, 0), (130, 114, 135), (110, 129, 133),
           (166, 74, 118), (219, 142, 185), (79, 210, 114), (178, 90, 62),
           (65, 70, 15), (127, 167, 115), (59, 105, 106), (142, 108, 45),
           (196, 172, 0), (95, 54, 80), (128, 76, 255), (201, 57, 1),
           (246, 0, 122), (191, 162, 208)]


def load_mask_from_person_video_ids(person_video_ids, ovis, person_cat_id, target_dir):
    for video_id in person_video_ids:
        video_info = ovis.vids[video_id]
        height, width, length = video_info['height'], video_info['width'], video_info['length']

        video_anns = ovis.vidToAnns[video_id]
        person_anns = [anns for anns in video_anns if anns['category_id'] == person_cat_id]

        for frame_id in tqdm(range(length)):
            frame_mask = np.zeros((height, width), dtype=np.uint8)
            for ann in person_anns:
                if ann['segmentations'][frame_id] is None:
                    continue
                mask = ovis.annToMask(ann, frame_id)
                mask_id = max(np.unique(frame_mask)) + 1
                frame_mask = np.where(mask > 0, mask_id, frame_mask)
            if len(np.unique(frame_mask)) > 0:
                file_path = video_info['file_names'][frame_id]
                video_name, frame_name = file_path.split('/')
                os.makedirs(os.path.join(target_dir, video_name), exist_ok=True)
                cv2.imwrite(os.path.join(target_dir, video_name, frame_name.replace('jpg', 'png')), frame_mask)


def load_mask_from_ovis(ovis_root):
    subsets = ['train']

    for subset in subsets:
        target_dir = os.path.join(ovis_root, 'labels', subset)
        os.makedirs(target_dir, exist_ok=True)

        json_file = os.path.join(ovis_root, f'annotations_{subset}.json')
        ovis = OVIS(json_file)

        # get person cat id
        person_cat_id = ovis.getCatIds(catNms=['Person'])[0]
        print(person_cat_id)

        # get person video ids
        person_video_ids = ovis.getVidIds(catIds=person_cat_id)
        print(person_video_ids)

        parallel_work(person_video_ids, load_mask_from_person_video_ids, ovis, person_cat_id, target_dir)


def visualization_label_files(label_files, target_dir):
    for root, file in label_files:
        video_name = root.split('/')[-1]
        os.makedirs(os.path.join(target_dir, video_name), exist_ok=True)
        raw_mask = cv2.imread(os.path.join(root, file), 0)
        h, w = raw_mask.shape[:2]
        color_mask = np.zeros((h, w, 3))
        instance_ids = np.unique(raw_mask)[1:]
        for instance_id in instance_ids:
            ci = int(instance_id) % len(PALETTE)
            color_mask[:, :, 0][raw_mask == instance_id] = PALETTE[ci][0]
            color_mask[:, :, 1][raw_mask == instance_id] = PALETTE[ci][1]
            color_mask[:, :, 2][raw_mask == instance_id] = PALETTE[ci][2]
        cv2.imwrite(os.path.join(target_dir, video_name, file), color_mask)


def visualization(ovis_root):
    subsets = ['train']

    for subset in subsets:
        label_dir = os.path.join(ovis_root, 'labels', subset)
        target_dir = os.path.join(ovis_root, 'visualizations', subset)

        label_files = []
        for root, dirs, files in os.walk(label_dir):
            for file in tqdm(files, total=len(files)):
                if file.endswith('png'):
                    label_files.append((root, file))

        parallel_work(label_files, visualization_label_files, target_dir)


if __name__ == '__main__':
    ovis_root = '/data/data/segmenation/instance_segmentation/OVIS'
    load_mask_from_ovis(ovis_root)
    visualization(ovis_root)

parallel_work是一个工具函数：

import numpy as np
import multiprocessing


def parallel_work(datas, worker, *args):
    n_cpu = multiprocessing.cpu_count()
    print('n_cpu', n_cpu)
    num_data = len(datas)
    stride = int(np.ceil(num_data / n_cpu))

    processes = []
    for i in range(n_cpu):
        end = min((i + 1) * stride, num_data)
        worker_data = datas[i * stride:end]

        process = multiprocessing.Process(
            target=worker,
            args=(worker_data, *args),
        )
        processes.append(process)
        process.start()
    for process in processes:
        process.join()

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