go kegg_玩转GO和KEGG富集因子图的N种姿势: 3种数据处理(含在线筛选条目),3种排序方式,本地交互图片...

本文介绍了如何进行GO和KEGG富集因子图的个性化处理,包括3种数据筛选方式和3种排序选项。通过在线工具,用户可以方便地根据需求筛选条目,即使不满足统计显著性条件。此外,还提供了本地交互图片功能,支持离线查看和数据探索,尤其适合科研过程中的数据分析。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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适用场景

富集性分析是各组学进行数据分析的必备分析项,其中,尤以GO和KEGG富集因子图最为常见,见封面图。这张图非常经典,相比于其他富集分析结果,它包含了基因数目、p值和富集因子三个维度的信息量,更全面,更能辅助下结论。

得到这张图有两种方式:

1. 从挑选基因开始做富集性分析,做完一套分析得到此图; 针对这个需求,出门左转,请使用【通用版富集分析】
通用版富集性分析​www.omicstudio.cn
2. 在富集性分析的基础上进行调整,包括基于这个结果重新选择数据绘制(一般默认绘制p值最小的前20项),数据在图中的排布方式,以及颜色字号调整等美化方案:
KEGG富集因子图​www.omicstudio.cn

本文主要基于第二种方式,关于第一种方式,刚刚进行了全面更新上线,增加了大量在线个性化调整的控件,后续会发文详细介绍,敬请期待哦。


3种数据处理方式

这张图的数据处理方案不是唯一的:比如默认是按p值从小到大前20项,那如果我关心的条目排位在第21个,是不是就不能画了呢&#

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