适用场景
富集性分析是各组学进行数据分析的必备分析项,其中,尤以GO和KEGG富集因子图最为常见,见封面图。这张图非常经典,相比于其他富集分析结果,它包含了基因数目、p值和富集因子三个维度的信息量,更全面,更能辅助下结论。
得到这张图有两种方式:
1. 从挑选基因开始做富集性分析,做完一套分析得到此图; 针对这个需求,出门左转,请使用【通用版富集分析】通用版富集性分析www.omicstudio.cn
2. 在富集性分析的基础上进行调整,包括基于这个结果重新选择数据绘制(一般默认绘制p值最小的前20项),数据在图中的排布方式,以及颜色字号调整等美化方案:KEGG富集因子图www.omicstudio.cn
本文主要基于第二种方式,关于第一种方式,刚刚进行了全面更新上线,增加了大量在线个性化调整的控件,后续会发文详细介绍,敬请期待哦。
3种数据处理方式
这张图的数据处理方案不是唯一的:比如默认是按p值从小到大前20项,那如果我关心的条目排位在第21个,是不是就不能画了呢&#