wddm.cpp opencv stitch_STITCH预测——小分子化合物与蛋白的关系网络

STITCH预测

小分子化合物与蛋白的关系网络

STITCH数据库是一个用于检索已知的或被预测的化合物和蛋白质之间互作关系的平台，其中包含了超过30000的小分子化合物以及来自1133个物种的260万个蛋白质之间的互作关系。该数据库根据文献以及从多个生物学途径、药物靶点关系和结合亲和力的数据库筛选资料整合了小分子和蛋白质的相互作用，相互作用关系主要整合自

BindingDB，PharmGKB和

the Comparative Toxicogenomics

数据库。

官方网址：(http://stitch.embl.de/)

与其他数据库相比，STITCH数据来源更广泛，依照关系来源的可靠性还有评分。同时比起其他数据库，STITCH数据库操作相对简单，检索得到的结果可视化效果也很不错，能够在检索到的同时直观地看到检索结果情况。

数据库界面如下，左侧为数据库检索方式，支持单个名称检索、多个名称检索、化合物结构检索、蛋白检索。右侧为检索框以及物种选择。

如果不选择物种则会根据你输入的蛋白或基因名称自动识别物种，但这样可能会导致数据量过大页面加载困难，因此使用时建议手动筛选物种。