linux的gromacs模拟分子运动,gromacs的拉伸往复运动

; VARIOUS PREPROCESSING OPTIONS =

title                    = Martini

cpp                      = /usr/bin/cpp

; RUN CONTROL PARAMETERS =

integrator               = md

; start time and timestep in ps =

tinit                    = 0.0

dt                       = 0.020

nsteps                   = 100000 ;2ns

; OUTPUT CONTROL OPTIONS =

; Output frequency for coords (x), velocities (v) and forces (f) =

nstxout                  = 0

nstvout                  = 0

nstfout                  = 0

; Output frequency for energies to log file and energy file =

nstlog                   = 500

nstenergy                = 200

; Output frequency and precision for xtc file =

nstxtcout                = 200

xtc_precision            =