ITK-SNAP自动分割应用示例：如何进行乳腺腺体脂肪体积测量

本文示例如何利用ITK-Snap自动分割功能进行乳腺腺体和脂肪体积的测量。

步骤：

1 选择蛇形按钮，在轴位、矢状位、冠状位调整欲分割的区域，包括乳腺。

2 点击“Segemnt 3D按钮”，进入自动分割区域。

3 选择欲采用的分割算法，针对动态增强序列，笔者尝试了Thresholding、Classification、Clustering、Edge Attraction几种方案，对于动态增强序列，以Clustering最优，其它序列可以尝试其它方法。

4 点击优化按钮进行分类优化，对腺体进行分割，首先选择该组织组织对应的类别，本例为“2”，点击next

5 添加种子点，尽量均匀可以连通到欲分割额组织全部，如图所示。

6 点击“迭代”按钮进行迭代。达到效果的时候点击完成。可以结合手动分割功能进行微调。

7 脂肪的分割如腺体。

图示步骤：

 注：步骤3为选了了“clustering”之后进行优化结果，步骤4 为查看该方法的最终效果，与其它方法进行比较而点击；步骤5位设置种子点，可以设置多个，并注意调整适当的大小，使之腺体在多个种子点的作用下成为一个准确的连通区域。

效果：

 

最后可以点击“Segmentation”菜单里面的“Volume and Statistics”查看定量结果。

 本介绍比较粗糙，需要小伙伴们对ITK-Snap的使用方法有一定的了解，细节使用可去B站搜索，有不少大牛有详细的视频介绍。