解密Hi-C数据分析中的分辨率

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Hi-C基于传统的染色质构象捕获技术，在DNA连接时引入生物素标记分子，标记交联的染色质，然后富集带有生物素标记的junction reads,  再结合高通量测序和下游的生物信息学分析，可以在全基因组范围内研究染色质的空间互作关系。

在Hi-C文库中，我们得到的是互作染色质形成的junciton reads, 通过将这些reads 比对到参考基因组之后，可以分析染色质之间的互作。以下图为例

图中蓝色和红色对应的染色质区域有互作，黑色和黄色对应的染色质区域有互作，在对应的Hi-C文库中，我们可以得到如下所示的junction reads

将这些reads正确比对到参考基因组上之后，就可以确定对应的染色质区域之间存在