RSNA 2024大揭秘：如何精准分类腰椎退行性病变？

RSNA 2024 Lumbar Spine Degenerative Classification

1、比赛说明

本次竞赛的目标是使用腰椎MR图像来帮助检测和分类退行性脊柱疾病。
根据世界卫生组织的数据，腰痛是全球残疾的主要原因，2020年将影响6.19亿人。大多数人在一生中的某个时候都会经历腰痛，其频率随着年龄的增长而增加。疼痛和活动受限通常是颈椎病的症状，这是一组退行性脊柱疾病，包括椎间盘退变和随后的椎管变窄(椎管狭窄)、关节下隐窝或神经孔，并伴有对下背部神经的压迫或刺激。
磁共振成像(MRI)提供了腰椎椎骨、椎间盘和神经的详细视图，使放射科医生能够评估这些疾病的存在和严重程度。这些疾病的正确诊断和分级有助于指导治疗和潜在的手术，以帮助缓解背痛，改善患者的整体健康和生活质量。
RSNA与美国神经放射学学会(ASNR)合作举办了这场比赛，探索人工智能是否可以用于使用腰椎MR图像来帮助检测和分类退行性脊柱疾病。

2、数据介绍

整体数据层级目录

2.1、train.csv数据说明

Index(['study_id', 'spinal_canal_stenosis_l1_l2',
       'spinal_canal_stenosis_l2_l3', 'spinal_canal_stenosis_l3_l4',
       'spinal_canal_stenosis_l4_l5', 'spinal_canal_stenosis_l5_s1',
       'left_neural_foraminal_narrowing_l1_l2',
       'left_neural_foraminal_narrowing_l2_l3',
       'left_neural_foraminal_narrowing_l3_l4',
       'left_neural_foraminal_narrowing_l4_l5',
       'left_neural_foraminal_narrowing_l5_s1',
       'right_neural_foraminal_narrowing_l1_l2',
       'right_neural_foraminal_narrowing_l2_l3',
       'right_neural_foraminal_narrowing_l3_l4',
       'right_neural_foraminal_narrowing_l4_l5',
       'right_neural_foraminal_narrowing_l5_s1',
       'left_subarticular_stenosis_l1_l2', 'left_subarticular_stenosis_l2_l3',
       'left_subarticular_stenosis_l3_l4', 'left_subarticular_stenosis_l4_l5',
       'left_subarticular_stenosis_l5_s1', 'right_subarticular_stenosis_l1_l2',
       'right_subarticular_stenosis_l2_l3',
       'right_subarticular_stenosis_l3_l4',
       'right_subarticular_stenosis_l4_l5',
       'right_subarticular_stenosis_l5_s1'],
      dtype='object')

train.csv为1975行×26列，其第一列为study_id表示样本的id号，从第二列开始到最后一列均为腰椎的分类标签
其中分类标签主要由下面五种:

{'left_subarticular_stenosis',
 'right_subarticular_stenosis',
  'spinal_canal_stenosis',
   'left_neural_foraminal_narrowing', 
   'right_neural_foraminal_narrowing'}

这些医学术语都与脊椎的退行性变和脊柱管狭窄有关，下面将详细解释每个术语：（left和right表示左侧和右侧）

1. left_subarticular_stenosis (左侧椎间孔狭窄): 椎间孔是脊椎骨之间的开口，允许神经根从脊髓出来分布到身体其他部位。当椎间盘退变或脊椎关节发生骨关节炎时，可以导致椎间孔变窄，这种情形称为椎间孔狭窄。左侧椎间孔狭窄即指发生在脊柱左侧的这一病变。
2. right_subarticular_stenosis (右侧椎间孔狭窄): 与左侧椎间孔狭窄类似，不过这种情况影响的是脊柱的右侧。
3. spinal_canal_stenosis (椎管狭窄): 椎管是脊椎骨组成的管道，其中包含脊髓和脊神经根。椎管狭窄是指这个管道变窄，从而压迫脊髓或神经根，常由椎间盘突出、骨刺形成或椎体滑脱引起。
4. left_neural_foraminal_narrowing (左侧神经根管狭窄): 神经根管是椎间孔内神经根出来的通道。左侧神经根管狭窄指的是影响脊柱左侧神经根出来的通道变窄，可能由周围结构的变化如椎间盘退变或骨刺造成。
5. right_neural_foraminal_narrowing (右侧神经根管狭窄): 同左侧神经根管狭窄，不过发生在脊柱的右侧。
   这些条件都可以导致疼痛、麻木或其他神经症状，治疗可能包括物理治疗、药物治疗、注射或在某些情况下可能需要手术干预。诊断通常依赖影像学检查，如X光、CT扫描或MRI扫描。
   上述五个类别再结合不同的椎间盘水平组成了所有的train，主要由下面五个和上面五个类别组成25列

{'_l1_l2', '_l4_l5', '_l2_l3', '_l5_s1', '_l3_l4'}

不同的椎间盘水平L1/L2、L2/L3、L3/L4、L4/L5和L5/S1五种情况中每一种的严重程度评分(正常/轻度、中度或重度)。
以字母 “L” 开头指的是 Lumbar腰椎，即腰部的脊椎部分。

在医学术语中，以 “L” 开头可能还代表其他一些词汇，如 “L1”、“L2” 等，这些通常指腰椎的具体位置，比如 L1 是第一腰椎。
对于不同椎间盘水平的解释如下：
L1/L2 (第一腰椎与第二腰椎): 这是脊柱的下部，位于胸椎和腰椎的交界处。第一腰椎是腰椎中最上面的一个，而第二腰椎是紧接着第一腰椎下面的一个。
L2/L3 (第二腰椎与第三腰椎): 这一水平位于L1/L2下方，第三腰椎是腰椎中位于中间的一个椎体。
L3/L4 (第三腰椎与第四腰椎): 这是腰椎的中部区域，第四腰椎位于第三腰椎下方。
L4/L5 (第四腰椎与第五腰椎): 这一水平位于L3/L4下方，第五腰椎是腰椎中最下面的一个椎体。
L5/S1 (第五腰椎与第一骶椎): 这是脊柱的最下端，连接着骶骨。第一骶椎是骶骨的最上面一个椎体，它与第五腰椎形成了脊柱的末端。
这些水平在解剖学和临床实践中非常重要，因为它们可能受到退行性变化的影响，如椎间盘退化、椎管狭窄和神经根压迫等。这些问题可能导致腰痛、下肢疼痛、麻木或其他神经症状。医生通常会使用影像学检查（如MRI或CT扫描）来评估这些水平的状况，并根据需要制定治疗计划。

2.2、train/test_series_descriptions说明

这个文件是关于训练数据的描述：主要有

['study_id', 'series_id', 'series_description']

在RSNA比赛中，‘study_id’, ‘series_id’, 'series_description’分别表示：

1. ‘study_id’: 研究ID，用于唯一标识一个医学影像研究项目。
2. ‘series_id’: 系列ID，用于唯一标识一个医学影像研究中的特定序列或扫描类型。
3. ‘series_description’: 系列描述，描述了该系列的具体信息，例如扫描技术、扫描范围等。
   
   使用study_id和series_id作为唯一标识符来检索特定的医学影像图片，因为图片就是根据study_id/series_id层级存放的，而series_description表示study_id/series_id组合下图片的分类标签。
   

通过对series_description列去重主要有下面三个类别：
这三个术语是MRI扫描中的一些序列类型。
Axial T2: 轴向T2加权成像是一种MRI扫描序列，它对组织的T2弛豫时间敏感。这种序列可以提供高对比度的图像，特别是对于水分含量较高的组织，如脑脊液、肌肉和肿瘤。
Sagittal T1: 矢状T1加权成像也是一种MRI扫描序列，它对组织的T1弛豫时间敏感。这种序列可以提供高对比度的图像，特别是对于脂肪和钙化等物质。
Sagittal T2/STIR: 矢状T2/短TI反转恢复(STIR)成像是一种MRI扫描序列，它结合了T2加权成像和STIR技术。STIR技术可以抑制脂肪信号，从而提供更清晰的图像。这种序列常用于检测炎症、水肿和肿瘤等病变。

2.3、train_label_coordinates说明

study_id：研究编号，表示不同的医学研究项目或对象的唯一标识。
series_id：系列编号，通常指的是特定研究编号下的一系列相关检查或数据集的标识。
instance_number：实例编号，可能表示单个被试或对象在特定系列中的编号。
condition：条件，描述了进行医学检查时的具体条件或病理状态，如“Spinal Canal Stenosis”指的是“椎管狭窄”。
level：水平，可能表示检查的具体部位或水平，如“L1/L2”表示腰椎的第一和第二椎骨之间。
X：X轴坐标值，可能表示在某种检查（如影像学检查）中标记点或感兴趣区域的X轴坐标。
y：Y轴坐标值，与X轴坐标类似，表示标记点或感兴趣区域的Y轴坐标。

例如，第一行记录了一个研究编号为4003253，系列编号为702807833的实例，在“Spinal Canal Stenosis”（椎管狭窄）条件，“L1/L2”水平下的X、Y坐标值分别为322.831858和227.964602。
其中condition就是对应train中的五个分类标签，level对应上面的五个椎间盘水平；

2.4、sample_submission说明

最终需要提交的格式

row_id：行编号，每个编号代表表格中的一行数据。
normal_mild：正常到轻度，这一列显示了从正常到轻度左脑前额叶功能受损的概率值。
moderate：中度，展示了中度左脑前额叶功能受损的概率值。
severe：重度，显示了重度左脑前额叶功能受损的概率值。

比如：44036939_left_neural_foraminal_narrowing_l1_l2这个是由study_id+condition+level组成的，表示在左神经椎间孔狭窄和左神经椎间孔狭窄的不同部位（如L1-L2, L2-L3等）以及左下方关节突狭窄在不同部位（如L1-L2, L2-L3等）情况下，正常到轻度、中度和重度左脑前额叶功能受损的概率值。

通过对所有数据的分析，可以看出来这个是一个图像三分类任务，最后对每个患者的情况进行一个评分。