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python学习笔记
文章平均质量分 66
木之如水
做个简单的人,享受简单的快乐!
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根据基因或者蛋白的id提取序列---extract_seq.exe
在面对需要提取某一个基因的序列时,大家会通过什么样的方式原创 2021-04-22 19:13:25 · 3951 阅读 · 0 评论 -
根据某一列的进行去重的小工具----duplicated.exe
在处理表达谱数据的时候,你是否遇到过在设置行名的时候,出现行名不同重复的问题,那时候的你会怎么处理呢?当年的我,花费了很大的力气,最后才解决这个问题,由刚开始的用excel一个一个手动删除,到现在用脚本删除,这个过程用了很长时间。现在为了让初学者更容易解决这个问题,不再走小编当前走过的艰难老路,小编将该部分功能进行封装,并做了可视化的界面,方便大家更好的理解和使用!首先,该软件是用python包装,大家需要在使用前安装python3.8及以上的版本,安装完成后,退出杀毒软件,解压压缩包。压缩包下有这么几原创 2021-04-20 19:48:37 · 852 阅读 · 5 评论 -
spell_picture第三版终于摆脱了命令行的操作
相比较前两版,在实现拼接图片的功能的同时,增加了一个可视化的界面,前面的步骤可以参考链接https://blog.csdn.net/weixin_43949246/article/details/109783239https://blog.csdn.net/weixin_43949246/article/details/109736601分别对应的第一版了第二版打开压缩包选择spell_picture3文件夹该文件夹下我们可以看到有一个spell_picture3.exe的软件,直接双击就可以原创 2020-11-23 21:54:08 · 383 阅读 · 1 评论 -
spell_picture二次升级版
相比较于第一版: 修改的内容为字体颜色修改了为白色,图片和图片之间存在了空隙,第一版的图片要求图片为正方形,现在就不需要了,可以看一下怎么使用首先一样下载安装包, 安装包可以私信告诉我哈。压缩后的文件里面总共有这几个文件首先安装python,双击安装就好了,需要注意的是,将工作环境添加进去,如果没有也没事,可以后期通过环境变量添加然后复制SimHei.ttf文件粘贴到C:\Windows\Fonts文件夹下。最后就是使用了,跟前面不一样的是这里没有-r的参数,多了一个-c的参数,之前的绘制是以行来原创 2020-11-18 20:28:47 · 429 阅读 · 2 评论 -
windows下一个好用直接拼接图片的软件spell_picture
为了减轻得到大量的荧光图片时拼图的烦恼,在这里包装了一个专门用于拼接图片的软件spell_picture。 在下载软件之前需要先安装python环境,默认是3.8以上版本就可以了安装过程在这里不展示了,直接默认就好了。 下载安装包之后会出现这几个文件 ![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/20201117100524382.png?x-oss-process=image/watermark,type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk,shadow_..原创 2020-11-17 10:26:16 · 2708 阅读 · 1 评论 -
python常见的文本处理-fasta文件格式处理
1、需要将下面的fasta文件进行一个整理,将序列单行输出方法一f1 = open('test1.fa','r').readlines()#需要整理的文件f2 = open('2.fasta','w')#整理之后的文件for i in f1: if i.startswith('>'): f2.write('\n'+i) else: f2.write(i.strip("\...原创 2019-11-13 17:39:03 · 5334 阅读 · 0 评论 -
python---count函数的用法---如何快速的进行计数
1、在不用count这个函数的情况下,如何对某一个列表进行计数首先创建一个列表list = ['qwe','xsa','jiu','qwe','xsa','jiu','www','oouy']s={}for i in list: if i not in s: s[i]=1 else: s[i]+=1for k in s: print(k,s[k])看着是不是很复杂,主要...原创 2019-10-29 16:24:46 · 18491 阅读 · 7 评论 -
python-字符串和文本
#如何将一个字符串分割成多个字段,但是分隔符并不固定line = ‘asdf fjdk; afed, fjek,asdf, foo’import re#按照;和,分割print(re.split(’[;,]’,line))#按照;和,空格分割print(re.split(’[;,\s]’,line))2、字符串开头和结尾匹配filename = ‘spam.txt’filena...原创 2019-06-23 16:12:38 · 294 阅读 · 0 评论