python生信脚本之fasta序列反向互补

1.如何使用python把fasta序列进行反向互补

后续还要再优化

def fasta2dict(fasta_name):
    with open(fasta_name) as fa:
        fa_dict = {}
        for line in fa:
            # 去除末尾换行符
            line = line.replace('\n','')
            if line.startswith('>'):
                # 去除 > 号
                seq_name = line[1:]
                fa_dict[seq_name] = ''
            else:
                # 去除末尾换行符并连接多行序列
                fa_dict[seq_name] += line.replace('\n','')
    return fa_dict

def DNA_rever_complement(sequence):
    trantab = str.maketrans('ACGTacgt', 'TGCAtgca')     # trantab = str.maketrans(intab, outtab)   # 制作翻译表
    string = sequence.translate(trantab)     # str.translate(trantab)  # 转换字符
    string_tmp = list(string)[::-1]
    string_fin = ''.join(string_tmp)

    return string_fin

a=fasta2dict('40.txt')
# b=[]
b1=open("41.txt","w")
for i in a.keys():
    b1.write(">"+str(i)+"\n")
    a1=DNA_rever_complement(a[i])
    b1.write(a1+"\n")
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