木舟总结 |2021年推文笔记分类汇总 先打个广告 木舟营业|关于付费咨询、有偿作图/数据分析、合作以及商务推广等事宜 高分文章图表复现系列 (免费教程+代码领取)|跟着Cell学作图系列合集 跟着CELL学作图|1.火山图跟着Cell学作图 | 2.柱状图+误差棒+散点+差异显著性检验跟着 Cell 学作图 | 3.箱线图+散点+差异显著性检验跟着 Cell 学作图 | 4.小提琴图跟着Cell学作图 | 5.UMAP降维分析跟着Cell学作图 | 6.时间序列分析(Mfuzz包)跟着Cell学作图|7.富集分析(Metascape数据库)跟着Cell学作图|8.富集分析网络图(Cytoscape/ClueGO)跟着Cell学作图|9.PPI分析(GeNets数据库)跟着Cell学作图|10.复杂热图跟着Cell学作图| 11.Ingenuity Pathway Analysis(IPA)跟着Cell学作图 | 12.韦恩图(Vennerable包)跟着Cell学作图 | 13.随机森林分类及其可视化(R包randomForest)跟着Nature学作图 | 配对哑铃图+分组拟合曲线+分类变量热图跟着Nat Commun学作图 | 1.批量箱线图+散点+差异分析跟着Nat Commun学作图 | 2.时间线图跟着Nat Commun学作图 | 3.物种丰度堆积柱状图跟着Nat Commun学作图 | 4.配对箱线图+差异分析R实战 | 对称云雨图 + 箱线图 + 配对散点 + 误差棒图 +均值连线 R实战 R绘图实战|GSEA富集分析图R绘图| Kaplan-Meier曲线及美化番外 |使用ComplexHeatmap绘制围棋盘主成分分析(PCA)及其可视化的基础指南答疑| ggplot 绘制火山图并添加文字标签单组学的多变量分析|1.PCA和PLS-DA单组学的多变量分析| 2.稀疏偏最小二乘判别分析(sPLS-DA)R实战 | 文章第一表:三线表的绘制Q&A | 如何用R批量绘制并导出生存曲线图Q&A | R做生存分析如何取最佳cutoff(截断)R实战 | OPLS-DA(正交偏最小二乘判别分析)筛选差异变量(VIP)及其可视化R 实战 | 使用clusterProfiler进行多组基因富集分析R实战 | 利用upset展示实验设计分组(ggupset)Q&A | 如何使用clusterProfiler对MSigDB数据库进行富集分析R实战|卡方检验及其可视化 R包指南 ggsci | 让你的配色Nature化ggpubr|让数据可视化更加优雅ggcorrplot | 简单的相关性热图绘制survminer | 生存分析及其可视化使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note1:简介使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note2:单个热图(上)使用ComplexHeatmap绘制复杂热图|Note2:单个热图(万字超详细教程)ggcor | 相关分析和可视化的扩展工具WGCNA 简明指南|1. 基因共表达网络构建及模块识别WGCNA 简明指南|2. 模块与性状关联分析并识别重要基因WGCNA 简明指南|3.使用WGCNA实现网络可视化单细胞转录组|Seurat 4.0 使用指南 《R数据科学》学习笔记 《R数据科学》学习笔记|Note1:绪论《R数据科学》学习笔记|Note2:使用ggplot2进行数据可视化(上)《R数据科学》学习笔记|Note3:使用ggplot2进行数据可视化(下)《R数据科学》学习笔记|Note4:使用dplyr进行数据转换(上)《R数据科学》学习笔记|Note5:使用dplyr进行数据转换(下)《R数据科学》学习笔记|Note6:使用tibble实现简单数据框《R数据科学》学习笔记|Note7:使用readr进行数据导入《R数据科学》学习笔记|Note8:使用dplyr处理关系数据《R数据科学》学习笔记|Note9:使用stringr处理字符串(上)《R数据科学》学习笔记|Note10:使用stringr处理字符串(下)《R数据科学》学习笔记|Note11:使用forcats处理因子《R数据科学》学习笔记|Note12:使用magrittr进行管道操作《R数据科学》学习笔记|Note13:函数《R数据科学》学习笔记|Note14:向量《R数据科学》学习笔记|Note15:使用purrr实现迭代(上)《R数据科学》学习笔记|Note16:使用purrr实现迭代(下) R语言基础 aggregate | 在R中进行分组统计apply | R中函数的简单循环R 中几个常见的合并数据集方法R 中几个常见的数据重塑函数R 中的 IF, ELSE, ELSE IF 语句的简单用法R绘图基础指南 | 1.条形图R绘图基础指南 | 2.折线图R绘图基础指南 | 3. 散点图(一)R绘图基础指南 | 3. 散点图(二)R绘图基础指南 | 3. 散点图(三) 读文献 文献解读|2019-nCoV感染后胆管细胞特异性ACE2表达可能导致肝损伤Cell | SnapShot:微生物群对宿主生理的影响.Nat Commun&JAMA INTERN MED|浅析两篇LASSO+Logistic/Cox 套路文章文献解读|柳叶刀:基于机器学习的急性冠脉综合征不良事件预测:一项汇集数据集的建模研究文献分享|代谢组学分析揭示了新冠肺炎的阶段性特征Nature Reviews Genetics | 在基因组学中应用机器学习的常见陷阱分享一篇 Science 里不同批次的单细胞数据整合及批次校正方法 机器学习基础 零基础"机器学习"自学笔记|Note1:机器学习绪论零基础"机器学习"自学笔记|Note2:单变量线性回归零基础"机器学习"自学笔记|Note3:梯度下降法零基础"机器学习"自学笔记|Note4:线性代数回顾零基础"机器学习"自学笔记|Note5:多变量线性回归零基础"机器学习"自学笔记|Note6:正规方程及其推导(内附详细推导过程)零基础"机器学习"自学笔记|Note7:逻辑回归零基础"机器学习"自学笔记|Note8:正则化 其它 Github项目笔记|学习正则表达式的简单方法 - END -