这图怎么画 | 相关分析棒棒糖图

最新推荐文章于 2024-11-10 13:10:34 发布

木舟笔记

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文章标签：人工智能数据分析数据挖掘机器学习可视化

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版权

Lollipop

写在前面

【这图怎么画】系列的图都来自VIP群里同学的提问。推文只是对图片的复现，不代表作者对图片展现形式的认同。欢迎同学们在群里分享有意思的图片。

本期图片

复现结果

❝
稍微调整了一下，原图把p值分层好多段，尤其是>0.05的部分，我觉得意义不大。
❞

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绘图

dat = read.csv("cor.csv")
head(dat)
# 对相关系数和p值转换为分类变量
dat$cor1 <- cut(abs(dat$cor),# 绝对值
                breaks = c(0, 0.3, 0.5, 0.7, 0.9, 1),
                labels = c("< 0.3","0.3 - 0.5","0.5 - 0.7","0.7 - 0.9","> 0.9"),
                right=FALSE) # right=FALSE表示表示区间为左闭右开
dat$pvalue1 <- cut(dat$pvalue,
                breaks = c(0, 0.001, 0.01, 0.05, 1),
                labels = c("< 0.001","< 0.01","< 0.05","> 0.05"),
                right=FALSE) 
# 排序
dat = dat[order(dat$cor),]
dat$Cell = factor(dat$Cell, levels = dat$Cell)
p = ggplot(dat, aes(x = cor, y = Cell, color = pvalue1)) +
  scale_color_manual(name="pvalue",
                     values = c("#E69F00", "#56B4E9", "#009E73", "gray"))+
  geom_segment(aes(x = 0, y = Cell, xend = cor, yend = Cell),size = 1) +
  geom_point(aes(size = cor1))+
  theme_bw()+
  labs(size = "Cor")
p

## 添加p值
dat$pvalue2 <- cut(dat$pvalue,
                   breaks = c(0, 0.05,1),
                   labels = c("< 0.05","> 0.05"),
                   right=FALSE) 
p1 = ggplot()+
  geom_text(dat,mapping = aes(x = 0, y = Cell, color = pvalue2, 
                              label = round(pvalue,3)))+
  scale_color_manual(name="",
                     values = c("red", "black"))+
  theme_void()+
  guides(color=F)
  
p1
library(patchwork)
p|p1

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