常用绘图网站 新手友好 239版

常用绘图网站

  1. MicrobiomeAnalysthttps://www.microbiomeanalyst.ca/MicrobiomeAnalyst/
  2. 生科云https://www.bioincloud.tech/task-meta
  3. 欧易生物https://cloud.oebiotech.cn/task/?page=6
  4. imageGPhttps://www.bic.ac.cn/ImageGP/
  5. 微生信http://www.bioinformatics.com.cn/
  6. Galaxyhttp://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/
  7. BioRender: https://biorender.com/
  8. Figdraw: https://www.figdraw.com/static/index.html

注意事项

每个绘图网站可以画不同的图,大家根据需要自己挑选:

  1. 使用前先了解下该网站的使用方法
  2. 不同网站有不同的导入文件格式,一定注意查看示例文件!查看示例文件!查看示例文件!
  3. 下述为推荐,但不是唯一

16S基础分析

Alpha多样性(箱线图)
MicrobiomeAnalyst — MDP Marker Data Profiling
可导出alpha原始数据表格后,使用其他绘制箱线图的网站绘图。

Beta多样性(PCA、PCoA、NMDS)
生科云、欧易生物、imageGP、微生信

物种组成(堆积柱形图)
生科云

差异菌(Lefse)
生科云、Galaxy、Stamp软件

相关性(热图)
生科云

网络图
生科云
生成的文件可以使用Cytoscape软件或Gephi软件绘图

Picrust 代谢通路分析
生科云、欧易生物
生成的文件可以使用Stamp软件绘图

文章机制图
BioRender、Figdraw

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