常用绘图网站
- MicrobiomeAnalyst:https://www.microbiomeanalyst.ca/MicrobiomeAnalyst/
- 生科云:https://www.bioincloud.tech/task-meta
- 欧易生物:https://cloud.oebiotech.cn/task/?page=6
- imageGP:https://www.bic.ac.cn/ImageGP/
- 微生信:http://www.bioinformatics.com.cn/
- Galaxy:http://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/
- BioRender: https://biorender.com/
- Figdraw: https://www.figdraw.com/static/index.html
注意事项
每个绘图网站可以画不同的图,大家根据需要自己挑选:
- 使用前先了解下该网站的使用方法!
- 不同网站有不同的导入文件格式,一定注意查看示例文件!查看示例文件!查看示例文件!
- 下述为推荐,但不是唯一!
16S基础分析
Alpha多样性(箱线图)
MicrobiomeAnalyst — MDP Marker Data Profiling
可导出alpha原始数据表格后,使用其他绘制箱线图的网站绘图。
Beta多样性(PCA、PCoA、NMDS)
生科云、欧易生物、imageGP、微生信
物种组成(堆积柱形图)
生科云
差异菌(Lefse)
生科云、Galaxy、Stamp软件
相关性(热图)
生科云
网络图
生科云
生成的文件可以使用Cytoscape软件或Gephi软件绘图
Picrust 代谢通路分析
生科云、欧易生物
生成的文件可以使用Stamp软件绘图
文章机制图
BioRender、Figdraw