【snippy报错】ERROR: Database check failed

项目场景：

提示：这里简述项目相关背景：

使用snippy4.6.0版本call snps，

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问题描述

提示：这里描述项目中遇到的问题：

手动下载的安装包，参考序列使用fasta文件时可以运行，使用gbk文件时出现报错

File %public/homeb20213050430/wyf/sxm/gene NDM/Result/169 extract snippy/reference/.refgenesgff line 2622CDS 1478615076snippyWARNING TRANSCRIPT NOT FOUND:CAMt fd TCT TRANSCRIPT JFONICPM 006. C TSC TRANSCRIPT JFONICPM 026 a Cee 'GENE FOcodon start : 1
gene : VirB4id : JFONICPM 00026
inference : ab initio prediction:Prodigal:002006,similar to AA sequence:UniProtKB:O9RPY1locus tag : FONICPM 00026name : virB4
product : Type IV secretion system protein virB4
source : snippytransl table : 1
PASIAO ·:MSVEKGL IRPALIRCLGVPL YPFL GMCVCVLIGVWHEAMYALIPGWYAKRVTKIDERFDIYLRMOKGNPL ANKRENAVHYAGSSYDAVDISK VDNEM
type : CDSFile%publichome20213050430/wyf'sxm/gene NDMMResult/169 extract sippyreferencel/refigenes gff line 27 2 1 Sippy CDS15101WARNING TRANSCRIPT NOT FOUND: TOO may "WARNNG RANSCRIPT NOT FOUND' wmngs. no futher waings wil be shown.
WARNING FRAMES ZERO: All frames are zero! This seems rather odd. please check that 'frame' iformation in vour 'genes' file is accurate.
ERROR: CDs check file /xxx/xx/reference/./ref'cds.fa' not found.
ERROR: Protein check file %ublichome b20213050430wvf/sxm/gene NDM/Result/169 extract snippv/reference//ref/orotein.fa' not found
ERROR: Database check failed.

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原因分析：

提示：这里填写问题的分析：

例如：查询后提示snippy和snpeff版本可能存在冲突，但根据snippy官方文件显示，版本符合要求，snippy版本为4.6.0，snpeff版本为5.1d。
进一步查询后发现，snpeff构建过程出现问题，此问题常出现于最新的5.1版本。

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解决方案：

提示：这里填写该问题的具体解决方案：
参考其他人的报错解决方案（https://groups.google.com/g/linux.debian.bugs.dist/c/660LIVsRuVc）后，解决方法如下：
1、使用conda创建新的虚拟环境，安装snippy=4.6.0和snpeff=5.0，为提升安装速度，首先安装mamba

##创建虚拟环境
conda create -n snippy
##激活虚拟环境
conda activate snippy
conda install -c conda-forge mamba
##使用mamba安装snippy和snpeff的特定版本
mamba install -y -c conda-forge -c bioconda -c defaults snpeff=5.0 snippy=4.6.0
##检查是否安装成功，版本是否正确