之前更新了看《庆余年》学科研绘图配色,我们也用在单细胞绘图里看看效果。
library(Seurat)
## Warning: 程辑包'Seurat'是用R版本4.3.3 来建造的
## 载入需要的程辑包:SeuratObject
## Warning: 程辑包'SeuratObject'是用R版本4.3.3 来建造的
## 载入需要的程辑包:sp
## Warning: 程辑包'sp'是用R版本4.3.3 来建造的
##
## 载入程辑包:'SeuratObject'
## The following object is masked from 'package:base':
##
## intersect
# 读取单细胞数据:
scRNA <- readRDS('pbmcrenamed.rds')
# 我们只有五个颜色:
scRNA <- subset(scRNA,idents = unique(Idents(scRNA))[1:5])
范闲配色
# 范闲配色:
DimPlot(scRNA,cols = c("#141A26", "#436043", "#9B9682", "#5C615D", "#23342C"))
范思辙配色
# 范思辙配色:
DimPlot(scRNA,cols = c("#1D74E7", "#E5EEF1", "#FEEB83", "#232734", "#36444E"))
林婉儿配色
# 林婉儿配色:
DimPlot(scRNA,cols = c("#D1C3AD", "#EEE572", "#CEDCE6", "#AFBF94", "#B9927F"))
海棠朵朵配色
# 海棠朵朵配色:
DimPlot(scRNA,cols =c("#ED9A7D", "#D8D6BB", "#F7EEB0", "#8D7B5A", "#80345C"))
个人觉得还不如我们此前分享的自此配色烦恼不相逢——ggsci看起来顺眼,更多单细胞可视化改造可参考:
单细胞图片改造计划: