利用丰度表,抽平、绘制稀释曲线
(TAO代码1)
问题描述
问题1:
计算 输出 diversity_rarefaction 时报错
问题2:
利用geom_smooth拟合曲线时报错
原因分析及解决方案:
问题1:
在抽平时,需将depth设置成最大的测序深度(或者不超过最大值),即计算多样性时的depth值。
问题2:
这个是警告,看起来没啥问题
警告的原因是因为有空值—可能有的样品测序量太少了,可能有的样品测序量太少了
即 目前的生成的稀释曲线的条数是小于样品数的,但是不能拟合的那几条不影响其他的,所以只是警告