稀释曲线
稀释曲线(Rarefaction Curve,也称稀疏曲线):一般在微生物组研究中用于评估测序量或样本量的饱和情况。稀释曲线通过从每个样本中随机抽取一定数量的序列(即在不超过现有样本测序量的某个深度下进行重新抽样),可以预测在一系列给定的测序深度下,所可能包含的物种总数及其中每个物种的相对丰度。因此,通过绘制稀释曲线,还可以在相同测序深度下,通过比较样本中ASV/OTU数的多少,从而在一定程度上衡量每个样本的多样性高低。
如何不使用R绘制稀释曲线?
小编和他的小伙伴们开发了一个在线的作图小网站——云图图(https://www.cloudtutu.com/#/index,免费的哦~),操作步骤如下:
①登录网址:https://www.cloudtutu.com/#/index(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(小编已经为大家填好了,如果不显示可添加文末二维码添加小编获取),输入验证码后即可登录,无需注册,直接使用,不必担心隐私泄露,是不是诚意满满~
③登录后在工具一栏(全部工具)里找到稀释曲线,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作,即可在2分钟内获得一张稀释曲线~
Step 01 上传文件
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